CD8+/CD103+ 肿瘤浸润淋巴细胞是肿瘤特异性组织驻留记忆T细胞及肺癌患者生存预后因素

研究关注 CD8+/CD103+ 肿瘤浸润淋巴细胞,将其鉴定为肿瘤特异性组织驻留记忆 T 细胞,并作为肺癌患者生存的预后因素

omicsdi
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基因组预测Transcriptomics
CD8+/CD103+ tumor-infiltrating lymphocytes are tumor-specific tissue-resident memory T cells and a prognostic factor for survival in lung cancer patients

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

CD8+/CD103+ 肿瘤浸润淋巴细胞是肿瘤特异性组织驻留记忆T细胞及肺癌患者生存预后因素

该数据集围绕肺癌中一类特定的肿瘤浸润淋巴细胞展开,核心研究对象为CD8+/CD103+肿瘤浸润淋巴细胞。相关研究将其鉴定为肿瘤特异性组织驻留记忆T细胞,并进一步探讨其作为肺癌患者生存预后因素的价值。数据集所属分类为肿瘤/肺癌,主题标签为转录组学(Transcriptomics),来源站为omicsdi.org。从源站描述可知,研究团队此前已证明CD103整合素在肺癌肿瘤浸润淋巴细胞克隆中能够促进特异性TCR介导的上皮性肿瘤细胞杀伤作用,但CD103对瘤内T细胞分布与功能的影响,以及非小细胞肺癌(NSCLC)中肿瘤浸润淋巴细胞亚群的预后意义,此前尚未得到系统性研究。本数据集正是针对这一空白,对这些细胞群体进行转录组谱分析,并以外周血单个核细胞(PBMC)作为对照。

【数据集背景】

肺癌是全球范围内发病率和死亡率均较高的恶性肿瘤,其中非小细胞肺癌(NSCLC)是最常见的病理类型。肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)在抗肿瘤免疫应答中扮演关键角色,而CD103作为一种整合素分子,此前已被证明在肺癌TIL克隆中促进特异性TCR介导的对上皮性肿瘤细胞的细胞毒性。然而,CD103在瘤内T细胞分布和功能方面的具体贡献,以及不同TIL亚群对NSCLC患者预后判断的意义,仍缺乏系统性的研究。该数据集正是在这一研究背景下产生,旨在通过转录组学手段深入刻画CD8+/CD103+肿瘤浸润淋巴细胞的分子特征,并将其与肿瘤特异性组织驻留记忆T细胞的表型及患者生存预后联系起来。

【数据内容】

该数据集的核心内容是针对CD8+/CD103+肿瘤浸润淋巴细胞群体所开展的转录组谱分析。研究以PBMC细胞作为对照,通过比较这些细胞群体的基因表达特征,来揭示其作为肿瘤特异性组织驻留记忆T细胞的分子基础。数据集的主题标签为Transcriptomics,表明其数据主体属于转录组学范畴。数据集所对应的研究关注CD8+/CD103+肿瘤浸润淋巴细胞,将其鉴定为肿瘤特异性组织驻留记忆T细胞,并作为肺癌患者生存的预后因素。关于具体的基因数量、样本数量、测序深度、表达矩阵规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为omicsdi.org。根据源站描述,研究团队此前已证明CD103整合素在肺癌肿瘤浸润淋巴细胞克隆中促进特异性TCR介导的上皮性肿瘤细胞细胞毒性,而本次研究则进一步系统性地探讨CD103对瘤内T细胞分布与功能的影响,以及TIL亚群在非小细胞肺癌中的预后意义。研究采用转录组学方法对这些细胞群体进行分析,并使用PBMC细胞作为对照。关于样本采集的具体地点、时间跨度、患者队列规模、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤免疫学、肺癌基础与转化研究、转录组学分析等领域。具体而言,可用于研究CD8+/CD103+肿瘤浸润淋巴细胞的分子表型、组织驻留记忆T细胞的特征解析、肺癌微环境中T细胞亚群的功能与分布,以及探索TIL亚群作为肺癌患者生存预后标志物的潜力。此外,由于数据集包含以PBMC为对照的转录组信息,也可用于比较肿瘤局部与外周血中T细胞群体之间的表达差异。关于该数据集是否适用于其他癌种或特定临床场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过来源站omicsdi.org获取。关于具体的数据下载方式、文件格式、数据处理流程、分析工具推荐或代码示例,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于转录组学方法,以PBMC细胞作为对照,对CD8+/CD103+肿瘤浸润淋巴细胞进行分析。其研究背景建立在CD103整合素促进特异性TCR介导的细胞毒性这一已有发现之上,并进一步探索TIL亚群在NSCLC中的预后意义。关于样本量大小、测序质量、批次效应、数据完整性、是否经过独立验证等质量相关指标,源站未提供。使用者在解释结果时需注意研究结论的适用范围,避免过度外推。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或相关发表文献信息,源站未提供。

下载信息

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-3266

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们先前已证实,肺肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)克隆上的CD103整合素在促进特异性TCR介导的上皮肿瘤细胞细胞毒性中发挥作用。然而,CD103对瘤内T细胞分布及功能的影响,以及TIL亚群在非小细胞肺癌(NSCLC)中的预后意义,迄今尚未得到系统性的探讨。在此,我们以PBMC细胞作为对照,研究这些细胞群体的转录组特征。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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