ATAD2是携带HLA-A*0201的小细胞肺癌患者的潜在免疫治疗靶点

该数据集来自omicsdi.org,属于肿瘤/肺癌分类,主题标签为Proteomics。数据围绕小细胞肺癌(SCLC)中可被HLA-I加工并呈递的免疫肽展开,对11株代表SCLC亚型异质性的细胞系进行了LC–MS/MS分析,其中10株确认为HLA-I阳性,1株为HLA-I缺陷

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蛋白质预测Proteomics
ATAD2 is a Potential Immunotherapy Target for Patients with Small Cell Lung Cancer Harboring HLA-A*0201

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

ATAD2是携带HLA-A*0201的小细胞肺癌患者的潜在免疫治疗靶点

该数据集聚焦于小细胞肺癌(SCLC)免疫治疗靶点研究,围绕HLA-A*0201限制性免疫肽的鉴定展开。研究以11株代表SCLC亚型异质性的细胞系为对象,通过LC–MS/MS分析,旨在识别可被HLA-I加工并呈递的免疫肽。其中10株细胞系经确认呈HLA-I阳性,1株为HLA-I缺陷。针对HLA-I缺陷细胞,研究采用健康献血者外周血单核细胞(PBMC),经DMS53细胞裂解物处理并成熟为树突状细胞(DC),以呈递肿瘤细胞抗原。该数据集属于肿瘤/肺癌分类,主题标签为Proteomics,来源于omicsdi.org,为探索SCLC免疫治疗靶点提供了蛋白质组学层面的数据支撑。

【数据集背景】

小细胞肺癌(SCLC)是一种异质性较强的肿瘤类型,其免疫治疗策略的开发依赖于对肿瘤细胞表面抗原呈递机制的深入理解。HLA-I分子在抗原加工与呈递过程中发挥核心作用,能够将细胞内来源的免疫肽展示于细胞表面,供细胞毒性T细胞识别。然而,SCLC中可被HLA-I加工并呈递的免疫肽谱尚不明确,尤其是不同亚型之间的差异以及HLA-I缺陷情况下的抗原呈递替代途径,均是需要探索的关键问题。该数据集正是基于这一背景,针对SCLC细胞系开展免疫肽组学分析,以揭示潜在的免疫治疗靶点。

【数据内容】

该数据集的核心内容为通过LC–MS/MS分析获得的免疫肽数据,覆盖11株SCLC细胞系,这些细胞系代表了SCLC亚型的异质性。在11株细胞系中,10株经确认呈HLA-I阳性,1株为HLA-I缺陷。对于HLA-I缺陷的细胞,研究采用健康献血者来源的PBMC,经DMS53细胞裂解物处理后成熟为树突状细胞(DC),以呈递肿瘤细胞抗原,从而分析细胞表面抗原。数据主题标签为Proteomics,属于肿瘤/肺癌分类。源站未提供具体的肽段序列、质谱参数、鉴定数量等详细信息。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。研究采用LC–MS/MS技术对11株SCLC细胞系进行分析,以鉴定可被HLA-I加工并呈递的免疫肽。细胞系的选择旨在代表SCLC亚型的异质性。对于HLA-I缺陷细胞,研究使用健康献血者来源的PBMC,经DMS53细胞裂解物处理并诱导成熟为DC,以呈递肿瘤细胞抗原。源站未提供样本采集时间、地点、伦理审批信息以及具体实验操作流程等细节。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤免疫学、肺癌研究以及蛋白质组学相关领域。具体而言,可用于探索SCLC中HLA-I限制性免疫肽的鉴定与特征分析,研究HLA-I缺陷肿瘤细胞的抗原呈递替代机制,以及筛选潜在的免疫治疗靶点。此外,该数据集可为开发针对SCLC的免疫治疗策略提供数据参考,尤其是针对HLA-A*0201阳性患者群体。源站未提供其他具体适用场景。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据格式、访问方式、分析工具或流程等。用户需参考omicsdi.org源站的相关说明以获取进一步信息。

【质量与限制】

该数据集基于11株SCLC细胞系,其中10株为HLA-I阳性,1株为HLA-I缺陷,样本量有限,可能无法完全反映SCLC患者的整体异质性。此外,HLA-I缺陷细胞的抗原呈递分析依赖于PBMC来源的DC模型,该模型与体内真实抗原呈递过程可能存在差异。源站未提供数据质量评估指标、验证实验或重复性信息。其他限制信息源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式及许可信息。用户需访问omicsdi.org源站以获取相关引用与许可要求。

下载信息

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使用方式

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源站:https://omicsdi.org/dataset/iprox/PXD058303

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为鉴定SCLC肿瘤细胞中可被HLA-I加工并呈递的免疫肽,我们对11株SCLC细胞系进行了LC–MS/MS分析,这些细胞系代表了SCLC各亚型的异质性。其中10株细胞系经确认HLA-I阳性,1株为HLA-I缺陷型。为分析HLA-I缺陷型细胞表面的抗原,我们将从健康献血者分离的PBMC用DMS53细胞裂解物处理,并使其成熟为DC以呈递肿瘤细胞抗原。

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