抗氧化剂加速小鼠肺癌进展

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-52594

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

抗氧化剂被广泛用于保护细胞免受活性氧（ROS）诱导的损伤。抗氧化剂有助于抗癌这一观念在普通人群中根深蒂固，受到食品补充剂行业的推动，并得到一些科学研究的支持。然而，临床试验报告的结果并不一致。在此，我们表明，在B-RAF和K-RAS诱导的肺癌小鼠模型中，向饮食中补充抗氧化剂N-乙酰半胱氨酸（NAC）和维生素E显著增加肿瘤进展并降低生存率。RNA测序显示，结构上无关的NAC和维生素E在肿瘤转录组谱中产生高度协调的变化，主要表现为内源性抗氧化基因表达的减少。NAC和维生素E通过减少小鼠和人类肺肿瘤细胞中的ROS、DNA损伤和p53表达来增加肿瘤细胞增殖。p53的失活使肿瘤生长增加的程度与抗氧化剂相似，并消除了抗氧化剂的作用。因此，抗氧化剂通过灭活ROS-p53轴加速肿瘤生长。

由于p53失活发生在肿瘤进展的晚期，抗氧化剂可能加速高风险人群（如吸烟者和接受NAC以缓解黏液产生的慢性阻塞性肺疾病患者）中早期肿瘤或癌前病变的生长。实验分为3组（未治疗组、NAC治疗组和维生素E治疗组）。每组包含5只动物，每只动物我们采集了2个肿瘤样本。因此，总共对3x10=30个样本进行了分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。