非小细胞肺癌miRNA与mRNA表达整合分析

它整合了非小细胞肺癌中microRNA与基因表达的全基因组分析,由GSE29248和GSE29249两个子系列组成,分别对应miRNA表达和mRNA表达数据

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
An Integrated Analysis of miRNA and mRNA Expressions of Non-small Cell Lung Cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

非小细胞肺癌miRNA与mRNA表达整合分析

该数据集名为“An Integrated Analysis of miRNA and mRNA Expressions of Non-small Cell Lung Cancer”,聚焦于非小细胞肺癌中微小RNA(microRNA)与信使RNA(mRNA)表达的综合分析。它由两个子系列构成:GSE29248用于非小细胞肺癌中microRNA表达的全基因组分析,GSE29249用于非小细胞肺癌中基因表达的全基因组分析。数据集在分类上归属于肿瘤/肺癌领域,主题标签为转录组学(Transcriptomics),来源站为omicsdi.org。整体而言,该数据集旨在通过整合miRNA与mRNA两个层面的表达信息,为理解非小细胞肺癌的转录调控特征提供数据基础,适用于转录组层面的探索性研究。

【数据集背景】

非小细胞肺癌是肺癌的主要类型之一,其发生发展涉及复杂的基因表达调控网络。microRNA作为重要的转录后调控因子,能够影响mRNA的稳定性和翻译效率,进而参与肿瘤相关通路的变化。因此,同时观察miRNA与mRNA的表达情况,有助于从调控关系的角度理解非小细胞肺癌的分子特征。该数据集正是围绕这一需求,整合了非小细胞肺癌中microRNA表达和基因表达的全基因组分析结果,形成由两个子系列组成的SuperSeries结构。

【数据内容】

该数据集包含两个子系列。第一个子系列为GSE29248,其内容是非小细胞肺癌中microRNA表达的全基因组分析;第二个子系列为GSE29249,其内容是非小细胞肺癌中基因表达的全基因组分析。两个子系列分别对应miRNA表达数据和mRNA表达数据,共同构成对非小细胞肺癌转录组两个层面的观察。数据集的主题标签为Transcriptomics,表明其属于转录组学范畴。关于样本数量、具体基因或miRNA条目、表达值矩阵、差异表达结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为omicsdi.org。其源站描述指出,这是一个SuperSeries,由GSE29248和GSE29249两个子系列组成,并建议参考各个子系列以获取详细信息。数据集英文名称为“An Integrated Analysis of miRNA and mRNA Expressions of Non-small Cell Lung Cancer”。关于样本采集地点、采集时间、平台信息、实验流程、受试者临床信息等,源站未提供。

【适用场景】

基于其转录组学主题和非小细胞肺癌背景,该数据集可适用于以下方向:非小细胞肺癌中miRNA与mRNA表达谱的联合分析;miRNA-mRNA调控关系的探索;非小细胞肺癌转录组层面的分子特征研究;以及作为相关生物信息学分析的公共数据资源。由于数据集由两个子系列组成,使用者可以分别利用miRNA表达数据和mRNA表达数据,也可以尝试将两者进行整合分析。具体适用场景需结合子系列的原始信息进一步确定,源站未提供更详细的适用建议。

【使用方法】

该数据集以SuperSeries形式组织,包含GSE29248和GSE29249两个子系列。源站描述建议参考各个子系列,因此使用时应分别访问两个子系列以获取对应的miRNA表达数据和基因表达数据。若需进行整合分析,可将两个子系列的数据按照样本对应关系进行合并或关联分析。关于数据下载格式、预处理步骤、标准化方法、分析工具推荐等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于omicsdi.org,并由两个子系列构成,其结构清晰,分别覆盖miRNA和mRNA两个表达层面。然而,关于数据质量评估、样本量、平台重复性、批次效应、缺失值情况、数据完整性等具体质量指标,源站未提供。此外,该数据集仅包含非小细胞肺癌相关的表达数据,不涵盖其他癌症类型或正常对照的详细说明,源站未提供。使用者在解释结果时需注意这些限制。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、原始文献信息等,源站未提供。

下载信息

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-29250

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该超级系列由以下子系列组成:GSE29248:非小细胞肺癌中microRNA表达的全基因组分析 GSE29249:非小细胞肺癌中基因表达的全基因组分析 请参阅各个子系列

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