健康吸烟者气道基底细胞表达与肺癌相关的胚胎干细胞特征

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-19722

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在多种上皮性癌症中，已观察到人类胚胎干细胞（hESC）特征基因的激活。本研究发现，在健康吸烟者的气道基底干/祖细胞群体（BC-S）中，hESC特征被选择性诱导，其模式与所有主要类型的人类肺癌中激活的模式相似。我们进一步鉴定出一组6个BC-S hESC基因，这些基因在肺腺癌中的一致性过表达与肺功能降低、分化程度较差、肿瘤分期更晚、生存期显著缩短以及TP53突变频率更高相关。BC-S与hESC及相当一部分肺 carcinoma 共享一种常见的TP53失活分子模式，该模式与BC-S hESC基因表达强烈相关。这些数据提供了基于转录组的证据，表明吸烟诱导的气道BC向hESC样表型的重编程，可能是人类侵袭性肺 carcinoma 发生过程中的一个常见早期分子事件。

采用Affymetrix芯片评估了通过纤维支气管镜从21名健康非吸烟者和31名健康吸烟者的大气道上皮中获取的与人类胚胎干细胞相关基因的表达数据，以及从4名健康非吸烟者和4名健康吸烟者的大气道上皮基底细胞培养物和4名个体的肿瘤组织细胞中获取的数据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。