点击化学衍生双核铜人工金属核酸酶AFM数据

该数据集来自 The University of Sheffield,对应一篇关于点击化学衍生双核铜人工金属核酸酶(AMN)的开发与体外抗癌评价研究

The University of SheffieldThe University of Sheffield
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基因组Biological physics
AFM data for: Development and In Vitro Anticancer Evaluation of a Click Chemistry Derived Dinuclear Copper Artificial Metallo-nuclease.

基本信息

模态
基因组
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

点击化学衍生双核铜人工金属核酸酶AFM数据

AFM data for: Development and In Vitro Anticancer Evaluation of a Click Chemistry Derived Dinuclear Copper Artificial Metallo-nuclease.

该数据集来自 The University of Sheffield,对应一篇关于点击化学衍生双核铜人工金属核酸酶(AMN)的开发与体外抗癌评价研究。数据包含原始 AFM 文件(.spm)、处理后的图像文件(.png)和分析文件(.csv)。研究中的 Cu2-BPL-C6 由点击化学制备,具有位点特异性 DNA 识别和低微摩尔切割活性,其配体设计通过脂肪族连接子分隔两个菲咯啉配体,迫使两个氧化还原活性铜中心结合 DNA。数据可用于肿瘤/肺癌相关的基础研究,支持 DNA 结合与切割行为的图像及分析(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2024。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):用于出版物的数据集:点击化学衍生双核铜人工金属核酸酶的设计与体外抗癌评价。包含原始 AFM 文件(.spm)、处理后的图像文件(.png)和分析文件(.csv)。具有人工金属核酸酶(AMN)活性的铜化合物在机制上不同于已确立的金属药物。在此,我们描述了一种新型双核铜 AMN,Cu2-BPL-C6(BPL-C6 = bis-1,10-phenanthroline-carbon-6)的开发,其使用点击化学制备,表现出位点特异性 DNA 识别和低微摩尔切割活性。BPL-C6 配体被设计为迫使两个氧化还原活性铜中心——对增强 AMN 活性至关重要——通过由脂肪族连接子分隔的两个菲咯啉配体结合 DNA。DNA 结合实验涉及圆二色光谱、琼脂糖凝胶电泳和荧光淬灭

【主题与分类】

主题标签:Biological physics。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://orda.shef.ac.uk/articles/dataset/AFM_data_for_Development_and_In_Vitro_Anticancer_Evaluation_of_a_Click_Chemistry_Derived_Dinuclear_Copper_Artificial_Metallo-nuclease_/27613857

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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源站:https://doi.org/10.15131/shef.data.27613857

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

用于发表的资料集:点击化学衍生双核铜人工金属核酸酶的设计及体外抗癌评估。包含原始AFM文件(.spm)、处理后的图像文件(.png)和分析文件(.csv)。具有人工金属核酸酶(AMN)活性的铜化合物在机制上不同于已有的金属药物。在此,我们描述了一种新型双核铜AMN——Cu2-BPL-C6(BPL-C6 = 双-1,10-邻菲罗啉-碳-6)的研发,该化合物通过点击化学制备,展现出位点特异性DNA识别能力,并具有低微摩尔级别的切割活性。BPL-C6配体设计旨在通过由脂肪族连接基分隔的两个邻菲罗啉配体,迫使两个具有氧化还原活性的铜中心——这是增强AMN活性的关键——与DNA结合。涉及圆二色光谱、琼脂糖凝胶电泳和荧光猝灭的DNA结合实验表明,该化合物偏好与富含腺嘌呤-胸腺嘧啶的DNA结合。

随后,通过体外分子和生物物理测定,包括液相原子力显微镜分析,阐明了Cu2-BPL-C6的氧化切割机制,揭示了通过超氧化物和过氧化氢氧化途径介导的有效DNA切割。利用外周血单核细胞进行单分子分析,发现经Cu2-BPL-C6处理的细胞中单链DNA损伤上调。通过使用特定的碱基切除修复(BER)酶,我们展示了Endo IV能选择性修复这些损伤,表明该复合物生成了无嘌呤和无嘧啶加合物。BPL-C6的广谱抗癌评估由美国国家癌症研究所的60种人类细胞系筛选(NCI-60)完成,并显示其对某些黑色素瘤、乳腺癌、结肠癌和非小细胞肺癌细胞系具有选择性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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