肝细胞癌中激酶增强T细胞介导细胞毒性的体外共培养CRISPR筛选支持数据

该数据集为肝细胞癌(HCC)中激酶增强T细胞介导细胞毒性的体外共培养CRISPR筛选的支持数据,来源于datahub.hku.hk,作者Ka Hei Lam,发布于2024年10月3日

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2024-10-03 更新
浏览 3
基因组分类HCC
Supporting data for “In vitro co-culture CRISPR screen for kinase potentiating T cell-mediated cytotoxicity in hepatocellular carcinoma”

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
许可
CC BY-NC 4.0
创建/更新时间
2024-10-03
版本
v1

资源简介

肝细胞癌中激酶增强T细胞介导细胞毒性的体外共培养CRISPR筛选支持数据

Supporting data for “In vitro co-culture CRISPR screen for kinase potentiating T cell-mediated cytotoxicity in hepatocellular carcinoma”

该数据集为肝细胞癌(HCC)中激酶增强T细胞介导细胞毒性的体外共培养CRISPR筛选的支持数据,来源于datahub.hku.hk,作者Ka Hei Lam,发布于2024年10月3日。数据围绕肿瘤内在激酶与细胞毒性T淋巴细胞(CTL)杀伤之间的关系,通过激酶组敲除CRISPR筛选在体外肿瘤-T细胞共培养体系中鉴定参与HCC细胞免疫逃逸的激酶,并结合TCGA HCC数据集的TIDE分析候选基因。该数据可用于研究HCC免疫治疗耐药机制及筛选增强免疫检查点阻断疗效的潜在靶点(来源 figshare,CC BY-NC 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2024-10-03。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肝细胞癌(HCC)患者对免疫检查点阻断(ICB)的总体缓解率仍不理想,凸显了亟需识别耐药因素并开发协同策略以增强ICB抗肿瘤活性的必要性。细胞毒性T淋巴细胞(CTL)是抗肿瘤免疫反应的核心效应细胞。理解肿瘤内在激酶与CTL介导的细胞毒性之间的关系,可能揭示促进免疫治疗疗效的新机制。在此,我们在体外肿瘤-T细胞共培养系统中进行了激酶组敲除(KO)CRISPR筛选,以鉴定HCC细胞中参与逃逸细胞毒性T细胞杀伤的免疫逃逸的激酶。在排名靠前的耗竭候选基因中,对癌症基因组图谱(TCGA)HCC数据集的肿瘤免疫功能障碍与排斥(TIDE)分析显示,较高的suppressor of morp

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.25442/hku.27060052.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Cancer cell biology。主题标签:HCC。本站分类:肿瘤/肝癌。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Cancer cell biology。

【获取与许可】

源站页面:https://datahub.hku.hk/articles/dataset/Supporting_data_for_i_In_vitro_i_co-culture_CRISPR_screen_for_kinase_potentiating_T_cell-mediated_cytotoxicity_in_hepatocellular_carcinoma_/27060052

使用许可:CC BY-NC 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/)。

规范引用:Lam, Ka Hei (2024). Supporting data for “In vitro co-culture CRISPR screen for kinase potentiating T cell-mediated cytotoxicity in hepatocellular carcinoma”. HKU DataHub. Dataset

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Ka Hei Lam (2024). Supporting data for “In vitro co-culture CRISPR screen for kinase potentiating T cell-mediated cytotoxicity in hepatocellular carcinoma” [Dataset]. http://doi.org/10.25442/hku.27060052.v1

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