肝细胞癌队列配对肿瘤与非肿瘤肝组织的鸟枪法脂质组学

该数据集来自肝细胞癌队列,包含配对肿瘤与非肿瘤肝组织的鸟枪法脂质组学数据,物种为 Homo sapiens,数据由 China Medical University 提供,采用 MS(Dir. Inf.) 方法

China Medical UniversityChina Medical University
metabolomics_workbench
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其他分类MS(Dir. Inf.)
ST005107: Shotgun lipidomics of paired tumour and non-tumour liver tissue from a hepatocellular carcinoma cohort

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

肝细胞癌队列配对肿瘤与非肿瘤肝组织的鸟枪法脂质组学

ST005107 是一个以肝细胞癌为研究背景的脂质组学数据集,收录于代谢组学工作台(metabolomicsworkbench.org),在站内归入肿瘤/肝癌分类。该数据集围绕配对肿瘤与非肿瘤肝组织展开,采用鸟枪法脂质组学(Shotgun lipidomics)进行检测,研究对象为 Homo sapiens,数据由 China Medical University 提供,所采用的代谢组学方法标记为 MS(Dir. Inf.)。整体而言,该数据集可用于比较同一肝细胞癌队列中肿瘤组织与相邻非肿瘤组织之间的脂质组成差异,为肝癌相关脂质代谢研究提供直接的组织水平数据支持。

【数据集背景】

肝细胞癌是常见的肝脏恶性肿瘤,其发生发展往往伴随脂质代谢重编程。针对配对肿瘤与非肿瘤肝组织开展脂质组学分析,有助于在同一个体内部消除部分个体间差异,更集中地观察肿瘤区域与非肿瘤区域之间的脂质分布变化。该数据集正是面向这一研究需求而建立,来源站将其归类于肿瘤/肝癌方向,主题标签为 MS(Dir. Inf.),物种为 Homo sapiens,来源机构为 China Medical University。

【数据内容】

该数据集的核心内容是来自肝细胞癌队列的配对肿瘤与非肿瘤肝组织的鸟枪法脂质组学数据。所谓配对,意味着同一队列中同时包含肿瘤组织及其对应的非肿瘤肝组织,便于进行组织类型之间的对照分析。检测方式为鸟枪法脂质组学,方法标记为 MS(Dir. Inf.)。数据集英文名称为 ST005107: Shotgun lipidomics of paired tumour and non-tumour liver tissue from a hepatocellular carcinoma cohort。除上述信息外,源站未提供更细化的脂质种类、样本数量、临床分期或具体分子列表。

【采集与来源】

该数据集来源于 metabolomicsworkbench.org,源站描述其为一项代谢组学研究,方法为 MS(Dir. Inf.),物种为 Homo sapiens, institute 为 China Medical University。数据由 China Medical University 提供。除来源站、来源机构、物种和方法标记外,源站未提供采样地点、采样时间、伦理审批信息或样本处理流程等更多采集细节。

【适用场景】

该数据集适用于肝细胞癌相关脂质代谢研究,尤其是需要在配对肿瘤与非肿瘤肝组织之间进行比较的场景。例如,可用于探索肿瘤组织相对于非肿瘤组织的脂质组成变化,也可作为肝癌脂质组学研究的验证或参照数据。由于采用鸟枪法脂质组学,该数据适合从脂质整体谱系层面开展分析。具体应用方向需结合源站提供的原始数据与元数据进一步确定,源站未提供明确的适用场景说明。

【使用方法】

使用该数据集时,可先访问 metabolomicsworkbench.org 上对应的 ST005107 条目,查看源站提供的元数据与数据文件。分析时可围绕配对设计,将肿瘤组织与非肿瘤肝组织进行对照,结合 MS(Dir. Inf.) 方法特点开展脂质组学数据处理。由于源站未提供详细的数据格式、预处理步骤和分析流程,具体使用方法需以源站条目中的实际说明为准,源站未提供标准化的使用指南。

【质量与限制】

该数据集来自 metabolomicsworkbench.org,并由 China Medical University 提供,具备明确的来源信息。其方法标记为 MS(Dir. Inf.),物种为 Homo sapiens,研究背景为肝细胞癌队列。限制方面,源站未提供样本量、质控指标、缺失值情况、批次效应或验证结果等信息,因此无法对数据质量作出进一步判断。此外,源站未提供临床注释、脂质鉴定置信度或定量策略等细节,使用时应结合源站原始条目自行评估。

【引用与许可】

该数据集来源于 metabolomicsworkbench.org,来源机构为 China Medical University。源站未提供具体的引用格式、许可条款或使用限制说明。如需引用或再利用,应以 metabolomicsworkbench.org 上 ST005107 条目的官方信息为准,源站未提供相关许可细节。

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使用方式

数据集获取

源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST005107

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Metabolomics study (MS(Dir. Inf.)). Species: Homo sapiens. Institute: China Medical University.

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