ST003988:HDAC抑制剂romidepsin引起的脂质与细胞周期扰动使肝癌对RTK靶向治疗敏感并具免疫活性
从标题所指向的科学问题看,该研究围绕组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂 romidepsin 对肝癌的作用展开,关注其引发的脂质代谢与细胞周期扰动,以及由此带来的肿瘤对受体酪氨酸激酶(RTK)靶向治疗的易感性变化和免疫活性改变

基本信息
资源简介
ST003988:HDAC抑制剂romidepsin引起的脂质与细胞周期扰动使肝癌对RTK靶向治疗敏感并具免疫活性
ST003988 是一项以液相色谱-质谱联用(LC-MS)为技术路线的代谢组学研究数据集,其英文标题为“Lipid and cell cycling perturbations driven by the HDAC inhibitor romidepsin render liver cancer vulnerable to RTK targeting and immunologically active”。从标题所指向的科学问题看,该研究围绕组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂 romidepsin 对肝癌的作用展开,关注其引发的脂质代谢与细胞周期扰动,以及由此带来的肿瘤对受体酪氨酸激酶(RTK)靶向治疗的易感性变化和免疫活性改变。
【数据集背景】
该数据集在收录体系中归入肿瘤/肝癌这一分类,说明其研究对象与肝脏恶性肿瘤相关。研究涉及的干预因素是 HDAC 抑制剂 romidepsin,这是一类通过影响染色质乙酰化状态来调节基因表达的化合物。标题提示,romidepsin 的处理会在脂质层面与细胞周期层面同时造成扰动,而这种扰动并非孤立事件,而是与肿瘤细胞对 RTK 靶向药物的应答、以及肿瘤免疫相关活性的改变联系在一起。换言之,该研究试图把表观遗传药物、代谢重编程、信号通路靶向与免疫应答这几条线索串联起来。关于研究的具体科学假设、实验设计动机、既往研究基础以及所针对的肝癌亚型,源站未提供。
【数据内容】
从技术类型看,该数据集属于代谢组学数据,检测平台为 LC-MS,即液相色谱分离与质谱检测相结合的分析方式,通常用于对小分子代谢物及脂质类成分进行相对或绝对定量。研究物种标注为人(Homo sapiens),即样本来源为人类。数据集标题中明确出现“lipid”一词,提示脂质相关代谢物是该研究关注的重要内容之一。除上述信息外,样本数量、分组方式、检测到的代谢物或脂质种类数目、原始数据文件格式与体积、是否包含定性注释表与定量矩阵等,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自代谢组学工作台(metabolomicsworkbench.org),这是其对外发布与索引的来源站点。研究工作由 CNRS 完成,即法国国家科学研究中心。来源站对该条目给出的描述十分简要,仅说明这是一项采用 LC-MS 技术的代谢组学研究,物种为人,完成机构为 CNRS。至于样本采集流程、伦理审批信息、队列或细胞模型的具体来源、色谱柱与流动相条件、质谱仪器型号与采集参数、数据预处理软件等细节,源站未提供。
【适用场景】
基于其分类与技术特征,该数据集可被用于与肝癌相关的代谢组学分析场景,尤其是围绕脂质代谢变化、细胞周期相关代谢扰动、HDAC 抑制剂药理机制、RTK 靶向治疗响应以及肿瘤免疫活性等方向的二次分析或横向比较。对于需要以 LC-MS 人类代谢组学数据作为参照或验证材料的研究者,该条目也可作为检索入口。需要说明的是,以上适用方向均来自数据集的归属分类与标题所反映的研究主题,具体可用于哪些分析、是否适合作为对照或验证集,仍需结合原始数据本身判断,源站未提供相关适用性说明。
【使用方法】
该数据集的具体获取方式、下载链接结构、文件组织方式、是否需注册或申请、配套的元数据表与数据处理建议,源站未提供。一般而言,LC-MS 代谢组学数据在下游使用中往往需要经过峰提取、对齐、归一化、注释与统计分析等步骤,但这些属于该技术领域的通用流程,并不代表该数据集已附带相应的处理结果或操作文档。
【质量与限制】
关于该数据集的质量控制信息,例如质控样本设置、内标使用、批间校正、缺失值比例、重复性指标等,源站未提供。其许可条款、使用限制与再分发条件同样未提供。使用者在引用或再利用前,应当自行核对原始条目所附的完整说明。此外,物种标注为人,意味着该数据反映的是人类样本或人类来源材料的结果,其结论能否外推到其他物种或模型,源站未提供依据。
【引用与许可】
该数据集的正式引用格式、作者列表、发表出处、DOI 或访问编号对应的许可协议,源站未提供。若需在论文或报告中使用该数据,建议直接访问代谢组学工作台上的对应条目,依据其页面所载信息完成引用与合规使用。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST003988
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
代谢组学研究(LC-MS)。物种:Homo sapiens。机构:CNRS。
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