ST003528:Alb-Cre +/- SART-/-(敲除)小鼠与同龄野生型同窝小鼠肝脏脂质组学分析,用于表征向肝脂肪变性和肝细胞癌的进展
该数据集来自 metabolomicsworkbench.org,为基于 LC-MS 的小鼠肝脏脂质组学研究,比较 Alb-Cre +/- SART-/- (KO) 小鼠与同龄野生型 WT 同窝小鼠,旨在表征肝脂肪变性及肝细胞癌的进展过程

基本信息
资源简介
ST003528:Alb-Cre +/- SART-/-(敲除)小鼠与同龄野生型同窝小鼠肝脏脂质组学分析,用于表征向肝脂肪变性和肝细胞癌的进展
ST003528 是一个公开的脂质组学数据集,全称为“Lipidomics profiling of livers from Alb-Cre +/- SART-/- (KO) versus age matched wild type WT mouse littermates to characterize progression to hepatic steatosis and hepatocellular carcinoma”。该数据集在肿瘤 / 肝癌分类下收录,来源为 metabolomicsworkbench.org。研究采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术,对小鼠肝脏组织进行脂质组学分析,比较 Alb-Cre +/- SART-/- 基因敲除(KO)小鼠与年龄匹配的野生型(WT)同窝小鼠之间的脂质谱差异,旨在表征从肝脂肪变性向肝细胞癌进展的过程。该数据集为探索肝脏脂质代谢改变与肝癌发生发展之间的关系提供了组学层面的实验数据基础。
【数据集背景】
该数据集聚焦于肝脏疾病尤其是肝细胞癌发生过程中的脂质代谢变化。研究使用 Alb-Cre +/- SART-/-(KO)小鼠模型,并将其与年龄匹配的野生型(WT)同窝小鼠进行对比。通过这种基因敲除与野生型的对照设计,研究者试图捕捉与肝脂肪变性及肝细胞癌进展相关的脂质组学特征。数据集的分类归属为肿瘤 / 肝癌,表明其应用背景与肝脏肿瘤研究密切相关。来源站为 metabolomicsworkbench.org,源站描述指出这是一项代谢组学研究,采用 LC-MS 技术,物种为 Mus musculus,研究机构为 University of Utah。
【数据内容】
该数据集的核心内容是小鼠肝脏的脂质组学谱。研究对象为 Alb-Cre +/- SART-/-(KO)小鼠与年龄匹配的野生型 WT 同窝小鼠的肝脏组织。数据通过 LC-MS 方法采集,属于代谢组学范畴下的脂质组学分析。数据集的主题标签为 LC-MS,说明液相色谱-质谱联用是其关键技术手段。数据内容旨在支持对肝脂肪变性及肝细胞癌进展过程的表征,比较基因敲除组与野生型对照组之间的脂质谱差异。除上述信息外,源站未提供关于具体脂质种类、样本数量、定量结果或统计分析的更多细节。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 metabolomicsworkbench.org。源站描述显示,这是一项代谢组学研究,采用 LC-MS 技术,研究物种为 Mus musculus,研究机构为 University of Utah。数据集英文名称中明确指出了比较对象为 Alb-Cre +/- SART-/-(KO)小鼠与年龄匹配的野生型 WT 同窝小鼠,研究目的是表征向肝脂肪变性及肝细胞癌的进展。关于样本采集的具体流程、实验条件、仪器型号、色谱与质谱参数等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肝脏脂质代谢与肝癌发生机制相关的研究场景。具体而言,可用于比较基因敲除小鼠与野生型小鼠肝脏脂质谱差异的分析,探索肝脂肪变性向肝细胞癌进展过程中脂质代谢的变化特征。由于主题标签为 LC-MS,该数据集也适合作为基于液相色谱-质谱联用技术的脂质组学方法参考或数据再分析对象。其肿瘤 / 肝癌分类表明,该数据可服务于肝癌生物标志物发现、代谢重编程研究等方向。但需注意,具体适用性取决于使用者对数据质量和实验设计的评估,源站未提供关于数据适用范围的进一步说明。
【使用方法】
该数据集可通过来源站 metabolomicsworkbench.org 获取。使用者可根据源站提供的数据访问方式下载或查询相关脂质组学数据。由于数据集基于 LC-MS 技术产生,使用时可结合脂质组学数据处理流程进行分析,例如峰提取、脂质鉴定、定量比较等。比较分析的设计应围绕 Alb-Cre +/- SART-/-(KO)小鼠与年龄匹配野生型 WT 同窝小鼠之间的差异展开。关于具体的数据格式、文件结构、预处理步骤或推荐分析工具,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 metabolomicsworkbench.org,源站描述确认其为 LC-MS 代谢组学研究,物种为 Mus musculus,机构为 University of Utah。然而,关于样本量、生物学重复、技术重复、数据完整性、缺失值比例、定量准确性、统计功效等质量相关指标,源站未提供。此外,该数据集仅涉及小鼠模型,向人类肝癌研究的转化需谨慎对待。数据集名称中提到的肝脂肪变性及肝细胞癌进展表征,其具体结论和验证程度源站未提供。使用者应结合源站原始信息自行评估数据质量与适用限制。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 metabolomicsworkbench.org。关于数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权声明,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时,应访问来源站查询相关的引用要求和许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST003528
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Metabolomics study (LC-MS). Species: Mus musculus. Institute: University of Utah.
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