ST001375:HepG2 肝癌细胞中果糖胺-3-激酶(FN3K)敲除
数据覆盖肿瘤/肝癌方向,可用于比较 FN3K 敲除与对照细胞之间的代谢物差异,支持代谢通路分析与潜在标志物探索等研究(来源 metabolomicsworkbench.org)

基本信息
资源简介
ST001375:HepG2 肝癌细胞中果糖胺-3-激酶(FN3K)敲除
ST001375 是一个以 Fructosamine-3-kinase(FN3K)敲除的 HepG2 肝癌细胞为研究对象的代谢组学数据集,英文全称为 Fructosamine-3-kinase (FN3K) KO in HepG2 liver cancer cells。该数据集归属于肿瘤 / 肝癌方向,来源于 metabolomicsworkbench.org,采用核磁共振(NMR)代谢组学技术,研究对象为人源细胞(Homo sapiens),数据由 University of Georgia 提供。整体来看,该数据集围绕 FN3K 基因敲除与对照细胞之间的代谢差异展开,可用于代谢通路分析、潜在标志物探索等研究,主题标签为 NMR,适合对肝癌细胞代谢重编程及 FN3K 功能感兴趣的科研人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集聚焦于肿瘤 / 肝癌研究方向,以 HepG2 肝癌细胞为实验体系,围绕 Fructosamine-3-kinase(FN3K)的敲除展开。FN3K 是一种与果糖胺代谢相关的酶,在细胞代谢调控中可能发挥作用。通过构建 FN3K 敲除细胞模型并与对照进行比较,研究者可以观察该基因缺失对细胞整体代谢物谱的影响。数据集来源于 metabolomicsworkbench.org,由 University of Georgia 提供,物种为人(Homo sapiens),属于代谢组学研究中较为典型的基因功能与代谢表型关联分析类型。
【数据内容】
该数据集的核心内容是 FN3K 敲除与对照 HepG2 细胞之间的代谢物差异比较,检测手段为 NMR(核磁共振)代谢组学。数据覆盖肿瘤 / 肝癌方向,可用于比较 FN3K 敲除与对照细胞之间的代谢物差异,支持代谢通路分析与潜在标志物探索等研究。关于具体样本数量、代谢物种类、检测平台型号、数据文件格式等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据采集自 metabolomicsworkbench.org,来源机构为 University of Georgia,研究物种为 Homo sapiens,实验体系为 HepG2 肝癌细胞。检测技术为 NMR。关于样本制备流程、培养条件、敲除方法、NMR 采集参数等实验细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤 / 肝癌方向的代谢组学研究,尤其适合围绕 FN3K 基因功能展开的代谢通路分析与潜在标志物探索。研究者可利用该数据比较 FN3K 敲除与对照细胞之间的代谢物差异,进而推断该基因在肝癌细胞代谢调控中的可能作用。此外,该数据集也可作为 NMR 代谢组学方法在细胞模型中的应用参考。关于是否适用于临床样本验证、药物响应预测等具体场景,源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 metabolomicsworkbench.org 获取。使用者可根据该站点提供的数据访问方式下载或查询相关数据。关于具体的数据下载格式、是否需要注册、是否提供分析脚本或预处理流程等,源站未提供。建议使用者结合 NMR 代谢组学的通用分析流程进行代谢物定性定量、差异分析和通路富集等后续研究。
【质量与限制】
该数据集来源于 metabolomicsworkbench.org,由 University of Georgia 提供,采用 NMR 技术,物种为人源 HepG2 细胞。关于数据质量评估指标、重复数、缺失值情况、归一化方法等,源站未提供。由于该数据集基于细胞模型,其结果向临床或体内情境的外推需谨慎。此外,FN3K 敲除可能带来脱靶效应或代偿性代谢变化,具体影响程度源站未提供。
【引用与许可】
该数据集英文名为 ST001375: Fructosamine-3-kinase (FN3K) KO in HepG2 liver cancer cells,来源站为 metabolomicsworkbench.org。关于引用格式、许可协议、使用限制等,源站未提供。建议使用者在使用前查阅 metabolomicsworkbench.org 上该数据集的官方页面,以获取准确的引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST001375
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Metabolomics study (NMR). Species: Homo sapiens. Institute: University of Georgia.
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