组织病理学诊断中肿瘤分子异质性的报告
该数据集来自 search.dataone.org,主题为组织病理学诊断中肿瘤分子异质性的报告,本站归类为肿瘤/肝癌。源站描述显示,研究采用靶向多基因下一代测序(TM-NGS)评估胃肠道肿瘤分子异质性,覆盖 35 例胃肠道肿瘤(包括肝细胞癌、胆管癌等七类,每类 5 例),检测 46 个癌症相关基因突

基本信息
资源简介
组织病理学诊断中肿瘤分子异质性的报告
Reporting tumor molecular heterogeneity in histopathological diagnosis
该数据集来自 search.dataone.org,主题为组织病理学诊断中肿瘤分子异质性的报告,本站归类为肿瘤/肝癌。源站描述显示,研究采用靶向多基因下一代测序(TM-NGS)评估胃肠道肿瘤分子异质性,覆盖 35 例胃肠道肿瘤(包括肝细胞癌、胆管癌等七类,每类 5 例),检测 46 个癌症相关基因突变,并利用一株壶腹部癌癌细胞系和一例肝脏癌肉瘤评估检测灵敏度。数据可用于肿瘤分子异质性识别与个性化治疗相关研究(来源 DataONE,CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:随着靶向治疗的出现,检测肿瘤分子异质性已变得至关重要。检测分析应全面、及时,并基于常规可获得的肿瘤样本。目的:评估靶向多基因下一代测序(TM-NGS)在表征胃肠道癌症分子异质性方面的诊断潜力。方法:使用 Ion Torrent 半导体 TM-NGS 评估 35 例胃肠道肿瘤(每类 5 例:肠型胃癌、胰腺导管腺癌、胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤、壶腹部癌、肝细胞癌、胆管癌、胰腺实性假乳头状肿瘤)中 46 个癌症相关基因的突变。一株壶腹部癌癌细胞系和一例肝脏癌肉瘤用于评估检测灵敏度
【主题与分类】
主题标签:Histopathological diagnosis、Personalized therapy、Homo Sapiens、Molecular heterogeneity、Next-generation sequencing。本站分类:肿瘤/肝癌。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Abdcfc71dcf9aec5f564b7aed40d621e37c73d5428a25b547671af61dbc034283
使用许可:CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。
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- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景:随着靶向治疗的出现,检测肿瘤分子异质性已变得至关重要。检测分析应全面、及时,并基于常规可获得的肿瘤样本。目的:评估靶向多基因下一代测序(TM-NGS)在表征胃肠道癌症分子异质性方面的诊断潜力。方法:采用Ion Torrent半导体TM-NGS技术,对35例胃肠道肿瘤——每种类型各5例,包括肠型胃癌、胰腺导管腺癌、胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤、Vater壶腹癌、肝细胞癌、胆管癌、胰腺实性假乳头状肿瘤——进行46个癌症相关基因的突变评估。使用一株Vater壶腹癌细胞系和一例肝脏癌肉瘤评估检测灵敏度。TP53、PIK3CA、KRAS和BRAF突变通过传统Sanger测序进行验证。结果……
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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