基于TCGA数据的早晚期肝细胞癌免疫浸润预后分析及生物标志物鉴定

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A0596c36128fd9895db3ecaffbb4ff05d1098c23176a58e0edf542036fdf57197

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究收集了八份人肝癌组织样本，其中四份来自早期肝癌患者，四份来自晚期肝癌患者。采用SYBR GreenⅠ实时PCR方法检测肝细胞癌患者组织样本中靶基因mRNA和miRNA转录水平的变化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。