PRJNA1419843：苯丙氨酸重编程 MASH-HCC 中 TLS 成熟与浆细胞分化 [空间转录组学]
该数据集来自 NCBI BioProject（编号 PRJNA1419843），标题为苯丙氨酸重编程 MASH-HCC 中 TLS 成熟与浆细胞分化，属于空间转录组学数据，本站归类为肿瘤/肝癌
![PRJNA1419843: Phenylalanine Reprograms TLS Maturation and Plasma cell differentiation in MASH-HCC [Spatial Transcriptomics]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/114881.jpg)
基本信息
资源简介
PRJNA1419843：苯丙氨酸重编程 MASH-HCC 中 TLS 成熟与浆细胞分化 [空间转录组学]
PRJNA1419843 是 NCBI BioProject 数据库收录的一项空间转录组学研究项目，英文全称为“Phenylalanine Reprograms TLS Maturation and Plasma cell differentiation in MASH-HCC [Spatial Transcriptomics]”。从标题可以看出，该研究聚焦苯丙氨酸对 MASH-HCC（代谢相关脂肪性肝炎相关肝细胞癌）中三级淋巴结构（TLS）成熟及浆细胞分化的重编程作用，并采用空间转录组学技术开展分析。本站将其归类为肿瘤/肝癌方向的数据集，主题标签为 Other。该项目为研究者提供了一个集中获取相关生物数据的入口，便于围绕肝癌微环境、免疫结构形成及代谢物调控机制等方向开展后续探索。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，编号为 PRJNA1419843。BioProject 是 NCBI 提供的一种资源组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的多种生物数据，这些数据通常来自单一机构或联合体。一个 BioProject 记录为用户提供统一入口，以便找到该项目所产生的不同类型的数据链接。本项目标题明确指向苯丙氨酸在 MASH-HCC 背景下对 TLS 成熟和浆细胞分化的重编程作用，并标注为空间转录组学方向。本站分类将其归入肿瘤/肝癌领域，主题标签为 Other。关于该研究的具体立项背景、资助信息及研究团队构成，源站未提供。
【数据内容】
该数据集属于空间转录组学数据，围绕苯丙氨酸重编程 MASH-HCC 中 TLS 成熟与浆细胞分化这一主题组织。标题中提及的 TLS 成熟与浆细胞分化提示研究可能涉及肝癌组织中免疫微环境的空间结构特征，但具体包含哪些样本、组织切片、基因表达矩阵、空间坐标信息或图像数据，源站未提供。数据的具体类型、文件格式、数据量及组织方式，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，收录于 NCBI BioProject 数据库，项目编号 PRJNA1419843。BioProject 记录本身是对一个研究计划相关生物数据的集合性描述，其数据可能来自单一组织或联合体。关于样本采集地点、采集时间、物种来源、伦理审批信息及具体实验平台，源站未提供。
【适用场景】
基于标题与分类信息，该数据集可能适用于肝癌微环境、三级淋巴结构形成、浆细胞分化以及苯丙氨酸代谢调控等方向的空间转录组学研究。由于本站将其归类为肿瘤/肝癌，相关领域的研究者可将其作为探索 MASH-HCC 免疫空间结构的参考数据。但具体适用的分析场景、可支持的假设检验类型及可复现的分析流程，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库以编号 PRJNA1419843 进行检索和访问。BioProject 记录提供指向该项目所产生各类数据的链接，用户可据此定位相关数据文件。关于数据下载方式、预处理步骤、分析工具推荐及空间转录组数据的标准处理流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共数据库收录的项目记录。关于数据质量评估指标、测序深度、空间分辨率、批次效应、样本量及潜在技术偏差等信息，源站未提供。使用者在解释结果时需注意项目标题所指向的研究结论尚未在本记录中展开，具体数据质量需结合原始数据文件自行判断。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可协议、使用限制及是否允许商业用途等信息，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应直接查阅 NCBI BioProject 记录 PRJNA1419843 及相关原始数据页面以获取最新的引用与许可要求。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1419843
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）是肝细胞癌（HCC）一个快速增长的病因，并与不良临床结局及对免疫检查点抑制剂反应有限相关。新出现的证据表明，肿瘤微环境内的免疫失调促进了疾病进展；然而，区分MASH相关HCC与非MASH HCC的转录程序仍未被完全阐明。为填补这一空白，我们对从MASH和非MASH肿瘤组织中分离的总RNA进行了bulk RNA测序。该数据集的生成旨在实现对与MASH驱动的肝癌发生相关的肿瘤内在和免疫相关通路进行比较转录组分析，尤其与免疫组织、代谢应激反应及肿瘤-免疫相互作用相关。所得的RNA-seq数据为研究可能导致MASH-HCC免疫功能障碍的免疫细胞相关基因特征、代谢通路及微环境特征的改变提供了资源。总体设计：C3H小鼠被喂食60%千卡高脂饮食（HFD；Research Diets, Inc.）8周。
为诱导非酒精性脂肪性肝炎（NASH），随后将小鼠转换为一种改良的蛋氨酸和胆碱缺乏（MCD）饮食，该饮食配方设计为60%千卡来自脂肪（Research Diets, Inc.）。年龄和性别匹配的对照组小鼠则维持非NASH对照饮食。在肿瘤接种前，通过标准组织学和代谢评估确认饮食干预后NASH表型的建立。确认NASH后，NASH组和对照组的小鼠均皮下接种HCA-1小鼠肝细胞癌细胞系。监测并测量肿瘤生长4周。在实验终点，收获肿瘤，在液氮中速冻，并储存在−80°C直至处理。对于RNA提取，冷冻的肿瘤组织被
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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