PRJEB126597:不可逆电穿孔与PDMS-M-EXO@PI微球治疗的原位大鼠肝细胞癌模型粪便微生物16S rRNA V3-V4扩增子测序

按源站原始描述,BioProject 是与单一倡议相关的生物数据集合,来源于单一组织或联盟;BioProject 记录为用户提供一个统一位置,以查找该项目产生的多种数据类型(来源 NCBI)

sra
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基因组分类Other
PRJEB126597: 16S rRNA V3-V4 amplicon sequencing of fecal microbiota in an orthotopic rat hepatocellular carcinoma model treated with irreversible electroporation and PDMS-M-EXO@PI microspheres

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJEB126597:不可逆电穿孔与PDMS-M-EXO@PI微球治疗的原位大鼠肝细胞癌模型粪便微生物16S rRNA V3-V4扩增子测序

16s_rat_hcc_ire_pi_2026 (ID 1530107) - BioProject - NCBI

该条目为 NCBI 的 BioProject,标题是“16s_rat_hcc_ire_pi_2026 (ID 1530107) - BioProject - NCBI”,源站标签为 Other。按源站原始描述,BioProject 是与单一倡议相关的生物数据集合,来源于单一组织或联盟;BioProject 记录为用户提供一个统一位置,以查找该项目产生的多种数据类型(来源 NCBI)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):BioProject 是与单一研究计划相关的一组生物学数据,源自单一机构或一个联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口,以便找到指向该项目所生成的各种数据类型的链接。

【主题与分类】

主题标签:Other。本站分类:肿瘤/肝癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB126597

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

从六组荷原位肝细胞癌大鼠的结肠中采集粪便样本(空白对照、模型、不可逆电穿孔 [IRE]、PI、PDMS-M-EXO@PI 和 IRE + PDMS-M-EXO@PI;每组 n = 3-4,共 21 份样本)。用引物 338F(ACTCCTACGGGAGGCAGCAG)和 806R(GGACTACHVGGGTWTCTAAT)扩增细菌 16S rRNA 基因 V3-V4 区,并在 Illumina NovaSeq 6000 平台上进行双端测序(2 x 250 bp)。该数据集支持在关于肝癌联合栓塞-免疫消融治疗的伴随研究中报道的肠道菌群重塑分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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