人肝癌细胞系HepG2单独多柔比星或联合丙戊酸或辛二酰苯胺异羟肟酸对比未处理对照的RNA-seq
数据可用于比较不同药物处理下 HepG2 细胞的基因表达差异，分析联合用药对转录组的影响，为肝癌药物响应与联合治疗机制研究提供转录水平依据（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
人肝癌细胞系HepG2单独多柔比星或联合丙戊酸或辛二酰苯胺异羟肟酸对比未处理对照的RNA-seq
PRJEB108989 是一个围绕人肝癌细胞系 HepG2 展开的 RNA-seq 研究项目，其核心设计是比较多柔比星单独处理，以及多柔比星分别与丙戊酸或伏立诺他（suberoylanilide hydroxamic acid）联合处理，与未处理对照之间的转录组差异。该数据集归属于肿瘤 / 肝癌方向，来源为 NCBI 的 BioProject 数据库。通过该项目产生的 RNA-seq 数据，研究者可以在转录水平上观察不同药物暴露条件下 HepG2 细胞的基因表达变化，进而为肝癌药物响应特征以及联合用药机制的探索提供数据基础。
【数据集背景】
该数据集对应的研究对象是人肝癌细胞系 HepG2。实验处理围绕多柔比星展开，并设置了两种联合用药方案：多柔比星与丙戊酸联合，以及多柔比星与伏立诺他联合。同时，项目包含未处理的对照组，用于与各药物处理组进行比较。整体设计旨在通过 RNA-seq 手段，获取不同药物处理条件下 HepG2 细胞的转录组信息，从而支持对肝癌细胞药物响应和联合治疗相关机制的研究。
【数据内容】
该数据集属于 RNA-seq 类型，样本来源于经多柔比星单独处理、多柔比星联合丙戊酸处理、多柔比星联合伏立诺他处理以及未处理对照的人肝癌细胞系 HepG2。其主题标签为 Other。数据可用于比较不同药物处理下 HepG2 细胞的基因表达差异，分析联合用药对转录组的影响，为肝癌药物响应与联合治疗机制研究提供转录水平依据。除上述信息外，源站未提供更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题显示其为 BioProject 记录，编号 ID 1442462，项目英文名称为 PRJEB108989。根据源站描述，BioProject 是围绕某一项研究计划收集的生物数据集合，这些数据可来自单一机构或联合体；BioProject 记录为用户提供一个统一入口，以便找到该项目所产生的多种数据类型。本站将其归类为肿瘤 / 肝癌。关于具体的建库方式、测序平台、测序深度、样本数量等采集细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于在转录水平上比较 HepG2 细胞在不同药物处理下的基因表达差异，分析多柔比星单独用药与联合丙戊酸或伏立诺他用药对转录组的影响，并可为肝癌药物响应与联合治疗机制研究提供转录水平依据。其主题标签为 Other，因此也可作为肝癌细胞药物处理相关转录组研究的参考数据。除上述适用方向外，源站未提供其他具体应用场景。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件格式、分析流程或推荐工具等。使用者如需利用该数据，应依据 NCBI BioProject 记录所提供的链接与说明进行进一步查询。源站描述仅说明 BioProject 记录可作为查找该项目多种数据类型链接的统一入口。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息，包括测序质量、重复数、批次效应控制、数据完整性等。该数据集基于人肝癌细胞系 HepG2 的体外实验，其结论外推到临床或其他细胞模型时需谨慎。除上述基于实验体系的一般性限制外，源站未提供其他质量与限制说明。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者应参考 NCBI BioProject 记录页面中可能提供的相关说明，并以源站发布的信息为准。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB108989
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为表征人肝细胞癌细胞系HepG2在接受多柔比星（DOX）单独处理或与组蛋白去乙酰化酶抑制剂丙戊酸（VPA）或辛二酰苯胺异羟肟酸（SAHA）联合处理后的转录组变化，进行了RNA测序，并以未处理细胞作为对照。HepG2细胞接受指定处理48小时。提取总RNA，并制备poly(A)富集的链特异性文库。在Illumina平台上进行双端测序。读段比对至人类参考基因组（GRCh38），随后进行基因水平定量和差异基因表达分析。该数据集可用于分析与HDAC抑制及DOX反应调控相关的转录程序，包括与DNA修复、应激反应和p53信号通路相关的通路。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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