PRJDB11023:人肝细胞癌肿瘤相关微生物群分析

在此,我们旨在阐明人肝细胞癌的肿瘤相关微生物群。我们比较了肿瘤组织与相邻非肿瘤组织中的微生物群。主题标签:肿瘤、肝癌、微生物群、肝细胞癌、肿瘤组织、癌旁组织

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其他分类肿瘤肝癌微生物群肝细胞癌肿瘤组织癌旁组织
其他PRJDB11023: Profiling tumor-associated microbiota of human hepatocellular carcinoma

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

PRJDB11023:人肝细胞癌肿瘤相关微生物群分析

PRJDB11023 是一个聚焦人肝细胞癌肿瘤相关微生物群的研究数据集,其英文名称为“Profiling tumor-associated microbiota of human hepatocellular carcinoma”。该数据集旨在阐明人肝细胞癌中与肿瘤相关的微生物群特征,研究方式是对比肿瘤组织与相邻非肿瘤组织中的微生物群。数据集在分类上归属于肿瘤 / 肝癌方向,来源站为 ebi.ac.uk。围绕肿瘤、肝癌、微生物群、肝细胞癌、肿瘤组织与癌旁组织等主题,该数据集为探索肝癌微环境中的微生物组成提供了可参考的研究材料,适合关注肝癌与微生物群关联的研究者了解和使用。

【数据集背景】

肝细胞癌是肝癌的主要类型之一,肿瘤微环境中的非肿瘤成分近年来受到关注,微生物群便是其中一类研究对象。该数据集所对应的研究以人肝细胞癌为对象,目标在于阐明肿瘤相关微生物群的特征。为达到这一目的,研究设计采用组织间对比的策略,将肿瘤组织中的微生物群与相邻非肿瘤组织中的微生物群进行比较,从而刻画肿瘤相关微生物群的组成特点。这一背景决定了数据集的核心价值在于提供肿瘤组织与癌旁组织微生物群对比的研究基础。

【数据内容】

该数据集的内容围绕人肝细胞癌的肿瘤相关微生物群展开,核心是比较肿瘤组织与相邻非肿瘤组织中的微生物群。主题标签涵盖肿瘤、肝癌、微生物群、肝细胞癌、肿瘤组织与癌旁组织,反映出数据内容涉及的组织类型与研究对象。关于数据的具体样本数量、测序平台、微生物分类单元丰度表、序列数据格式等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk,英文名称为“Profiling tumor-associated microbiota of human hepatocellular carcinoma”。研究采集的对象为人肝细胞癌的肿瘤组织及其相邻非肿瘤组织,用于微生物群比较分析。关于样本采集地点、采集时间、受试者数量与临床信息、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与人肝细胞癌肿瘤相关微生物群相关的研究场景,例如比较肿瘤组织与癌旁组织微生物群组成差异、探索肝癌微环境中微生物群特征等方向。由于主题标签涵盖肿瘤、肝癌、微生物群、肝细胞癌、肿瘤组织与癌旁组织,该数据集也可作为肝癌与微生物群交叉研究的参考材料。关于具体分析流程、统计方法或验证实验的适用性,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可用于围绕肿瘤组织与相邻非肿瘤组织微生物群对比的分析工作。使用者可依据研究目的,将肿瘤组织与癌旁组织的微生物群数据进行对照比较,以考察肿瘤相关微生物群的特征。关于数据下载方式、文件组织格式、预处理步骤与推荐分析工具等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于肿瘤组织与相邻非肿瘤组织的微生物群比较设计,主题明确,聚焦人肝细胞癌。关于样本量、测序深度、数据完整性、批次效应、污染控制以及结果的普适性等质量相关指标,源站未提供。使用者应注意,该数据集的具体技术细节与质量评估信息需以源站实际内容为准。

【引用与许可】

该数据集的英文名称为“PRJDB11023: Profiling tumor-associated microbiota of human hepatocellular carcinoma”,来源站为 ebi.ac.uk。关于引用方式、许可协议、使用限制与数据访问政策等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB11023

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在此,我们旨在阐明人类肝细胞癌的肿瘤相关微生物群。我们比较了肿瘤组织与邻近非肿瘤组织中的微生物群。

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