胎盘生长因子作为原位小鼠模型中肝细胞癌潜在靶点

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-35289

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胎盘生长因子（PlGF）是血管内皮生长因子（VEGF）家族的成员，已知能刺激内皮细胞的生长、迁移和存活，吸引具有血管生成能力的巨噬细胞和骨髓祖细胞，并决定转移微环境。与VEGF不同，遗传学研究显示PlGF特异性地参与病理性血管生成，因此其抑制不会影响健康的血管，提供了一个具有良好安全性特征的有吸引力的候选药物。在本研究中，我们通过使用PlGF基因敲除小鼠和针对PlGF的单克隆抗体，在肝细胞癌（HCC）的原位模型中评估了抑制PlGF是否可作为HCC的潜在治疗手段。此外，还将PlGF抗体的效果与索拉非尼以及两者联合治疗的效果进行了比较。

在我们的研究中，我们发现在转基因敲除模型和治疗模型中，沉默或抑制PlGF均能显著降低肿瘤负荷，这不仅通过抑制血管生成，还通过减少肝脏巨噬细胞募集和使残余血管正常化，从而减少缺氧，进而降低HCC的促转移潜能。结论：考虑到其良好的安全性特征及其对血管生成、转移和炎症的多效性作用，靶向PlGF可能成为对抗HCC的一种有价值的治疗策略。在小鼠基因表达微阵列（Agilent）上进行的杂交为每张芯片单样本、单色模式，使用花菁-3（Cy3）标记。评估了以下条件：25W DEN + 5W αPlGF肿瘤组织（n = 5）、25W DEN + 5W αPlGF周围组织（n = 4）、25W DEN + 5W IgG肿瘤组织（n = 5）、25W DEN + 5W IgG周围组织（n = 4）、25W生理盐水 + 5W αPlGF（n = 3）和25W生理盐水 + 5W IgG（n = 3）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。