蒙古西部肝细胞癌
该数据集来自 omicsdi.org，聚焦蒙古与西方肝细胞癌（HCC）的分子特征比较。数据涵盖蒙古患者 192 例与西方患者 187 例，包含 RNA-seq 与 WES 数据
基本信息
资源简介
蒙古西部肝细胞癌
该数据集来自 omicsdi.org，聚焦蒙古与西方肝细胞癌（HCC）的分子特征比较。数据涵盖蒙古患者 192 例与西方患者 187 例，包含 RNA-seq 与 WES 数据。蒙古患者以年轻、女性、HBV-HDV 非肝硬化肝脏为主，其肿瘤蛋白编码突变率更高（121 vs 70 突变/肿瘤），并存在 APOB、TSC2 等已知或潜在驱动突变。研究还发现一种新型突变特征 SBS Mongolia，见于 25% 病例，与致癌性 DMS 特征相关。数据可用于肝癌分子分型、突变特征分析及东西方差异研究（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：蒙古拥有全球最高的肝细胞癌（HCC）发病率，约为每 10 万居民 100 例。我们通过 RNA-seq 和 WES 对蒙古（n=192）与西方 HCC（n=187）进行了分子特征比较。蒙古患者主要为较年轻、女性、HBV-HDV 非肝硬化肝脏。蒙古 HCC 的蛋白编码突变率更高（西方为 70 突变/肿瘤，蒙古为 121 突变/肿瘤），并在已知（即 APOB）和推测的 HCC 驱动基因（TSC2）中存在突变。在 25% 的病例中鉴定出一种新型突变特征（SBS Mongolia），与致癌性 DMS 基因毒性特征相关。描述了两种独特的分子类别，分别富集于 HBV-HDV 感染、女性性别和炎症性肿瘤。
【主题与分类】
主题标签：Genomics。本站分类：肿瘤/肝癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001005364
下载信息
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数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001005364
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
蒙古国的肝细胞癌（HCC）发病率居全球之首，约为每10万居民100例。我们通过RNA测序和外显子组测序，对蒙古国HCC（n=192）与西方HCC（n=187）进行了分子特征比较。蒙古国患者以较年轻、女性为主，且多伴有HBV-HDV感染但无肝硬化的肝脏。蒙古国HCC的蛋白编码突变率较高（每肿瘤121个突变，西方为70个），并在已知（如APOB）和推测的HCC驱动基因（TSC2）中发现了突变。在25%的病例中鉴定出一种新的突变特征（SBS Mongolia），与致癌性DMS基因毒性特征相关。描述了两种独特的分子类别，分别富集于HBV-HDV感染、女性性别和炎症性肿瘤。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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