MicroRNA表达谱预测符合Milan标准轻度肝硬化肝癌患者的复发
研究利用microRNA表达谱评估肝癌患者肝切除术后复发风险,检测了73例符合Milan标准且伴有轻度肝硬化(Child-Pugh A/B)的HCC患者的配对肿瘤与非肿瘤肝组织

基本信息
资源简介
MicroRNA表达谱预测符合Milan标准轻度肝硬化肝癌患者的复发
该数据集围绕肝细胞癌(HCC)术后复发风险预测展开,利用microRNA表达谱对符合Milan标准且伴有轻度肝硬化的患者进行风险评估。研究纳入73例HCC患者,这些患者肝功能为Child-Pugh A/B级,并接受了肝切除手术。数据集的核心在于对配对肿瘤组织与非肿瘤肝组织进行microRNA表达谱检测,并在此基础上构建复发-free生存预测模型。通过Cox比例风险模型与主成分分析,研究尝试从表达谱中提取与复发相关的信号。该数据集属于肿瘤/肝癌领域,主题标签为Transcriptomics,来源站为omicsdi.org,可为肝癌复发机制研究和预后标志物挖掘提供转录组层面的数据支持。
【数据集背景】
肝细胞癌是常见的恶性肿瘤之一,术后复发是影响患者长期生存的关键问题。对于符合Milan标准且伴有轻度肝硬化的患者,肝切除术后仍存在复发风险,因此需要更精细的风险分层工具。本研究聚焦于microRNA表达谱,旨在评估其预测HCC复发的能力。Milan标准通常用于肝移植筛选,而该研究将其作为入组条件之一,结合Child-Pugh A/B级轻度肝硬化状态,构建了一个相对均质的患者群体。通过配对肿瘤与非肿瘤肝组织的表达谱分析,研究试图揭示与复发相关的分子特征,并建立预测模型。这一背景体现了转录组学在肿瘤预后研究中的应用价值。
【数据内容】
数据集包含73例HCC患者的配对肿瘤与非肿瘤肝组织的microRNA表达谱。患者均符合Milan标准,且伴有轻度肝硬化(Child-Pugh A/B)。研究基于这些表达谱数据,构建了复发-free生存的预测模型,使用了Cox比例风险模型和主成分分析方法。主题标签为Transcriptomics,表明数据属于转录组学范畴。源站未提供具体的microRNA数量、表达值矩阵、临床变量详细列表或模型性能指标等更细粒度的信息。
【采集与来源】
数据来源于omicsdi.org,源站描述指出研究检测了73例HCC患者的配对肿瘤与非肿瘤肝组织。患者入组条件包括符合Milan标准、伴有轻度肝硬化(Child-Pugh A/B),并接受肝切除手术。研究利用microRNA表达谱评估术后复发风险。源站未提供具体的样本采集时间、地点、测序平台或实验流程等细节。
【适用场景】
该数据集适用于肝癌复发相关的转录组学研究,尤其是microRNA表达谱在预后预测中的应用。可用于探索符合Milan标准且轻度肝硬化患者术后复发的分子机制,或用于验证基于Cox比例风险模型和主成分分析的预测模型。也可作为方法学参考,用于构建复发-free生存预测模型。源站未提供具体的适用场景限制或推荐分析工具。
【使用方法】
源站未提供具体的数据使用说明、文件格式、预处理步骤或分析代码。用户需依据源站描述自行判断如何利用配对肿瘤与非肿瘤组织的microRNA表达谱进行复发风险建模。源站未提供访问权限、下载方式或使用协议等细节。
【质量与限制】
源站未提供数据质量评估、缺失值处理、批次效应校正或模型验证结果等信息。样本量较小(73例),且患者群体限定为符合Milan标准且轻度肝硬化者,可能限制结论的外推。源站未提供具体的局限性说明或质量控制指标。
【引用与许可】
源站未提供引用格式、许可协议或数据使用条款。用户需自行查阅omicsdi.org上该数据集的原始页面以获取引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-21362
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在本研究中,我们利用microRNA表达谱来评估肝癌切除术后复发的风险。我们检测了73例满足米兰标准的轻度肝硬化(Child-Pugh A/B级)肝癌患者的配对肿瘤与非肿瘤肝组织中的microRNA表达谱。我们运用Cox比例风险模型和主成分分析构建了无复发生存的预测模型。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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