LiverHccSeg:公开多期MRI肝脏与HCC肿瘤分割数据集及评估者间一致性分析
LiverHccSeg 是一个公开的多期对比增强 MRI 数据集,提供肝脏与肝细胞癌(HCC)肿瘤的分割标注,并包含评估者间一致性分析

基本信息
资源简介
LiverHccSeg:公开多期MRI肝脏与HCC肿瘤分割数据集及评估者间一致性分析
LiverHccSeg: A Publicly Available Multiphasic MRI Dataset with Liver and HCC Tumor Segmentations and Inter-Rater Agreement Analysis
LiverHccSeg 是一个公开的多期对比增强 MRI 数据集,提供肝脏与肝细胞癌(HCC)肿瘤的分割标注,并包含评估者间一致性分析。数据覆盖多期对比增强磁共振成像,可用于 HCC 的无创检测与诊断研究。该数据集适用于肝脏和肿瘤的自动分割算法开发与评测,也可支撑分割结果一致性、标注可靠性等相关研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2023。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):请引用我们发表在《Data in Brief》上的数据论文: 背景:肝癌是全球癌症相关死亡的第三大原因[1],令人担忧的是,肝癌的发病率和死亡率均在上升[2; 3]。在各种原发性肝癌类型中,肝细胞癌(HCC)最为常见,约占肝癌病例的70-85%[4]。借助磁共振(MR)成像的优势,HCC无需侵入性活检即可被可靠地检测和诊断[5]。MR成像提供高组织对比度,可通过对比增强多期磁共振成像(mpMRI)技术进一步增强。这使得HCC的准确识别和无创诊断成为可能[6]。目标:精确的se
【主题与分类】
主题标签:Liver Cancer、MRI、TCIA、TCGA-LIHC、Hepatocellular Carcinoma、Liver Segmentation、Tumor Segmentation、HCC、multiphasic contrast-enhanced MRI、Magnetic Resonance Imaging。本站分类:肿瘤/肝癌。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.7957515
使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。
下载信息
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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.7957515
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据集大小约 2.63 GB。
数据说明
请引用我们发表在《Data in Brief》上的数据论文:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352340923007473
背景
肝癌是全球癌症相关死亡的第三大原因[1],令人担忧的是,肝癌的发病率和死亡率均在上升[2; 3]。在各类原发性肝癌中,肝细胞癌(HCC)最为常见,约占肝癌病例的70-85%[4]。借助磁共振(MR)成像的优势,HCC无需侵入性活检即可被可靠地检测和诊断[5]。MR成像具有高组织对比度,并可通过对比增强多期磁共振成像(mpMRI)技术进一步增强。这使得HCC的准确识别和非侵入性诊断成为可能[6]。
目的
肝脏的精确分割在体积测量评估中起着至关重要的作用,并且是后续肿瘤检测算法的重要预处理步骤[7]。
然而,对于存在癌症相关组织改变和形状变形的患者,准确的肝脏分割可能尤为具有挑战性[8]。准确的HCC肿瘤分割对于提取放射组学等定量影像生物标志物至关重要,可用于治疗反应评估和预后评价研究,并提供有关肿瘤生物学的关键信息。为了提高肝脏和肿瘤分割的可重复性,人们开发了利用图像分析技术和机器学习的自动化方法。这些方法已展现出令人鼓舞的结果[7; 8];然而,大多数算法仅在小型内部测试集上进行了测试,因此无法保证在外部数据上具有可推广且一致的性能。公开可用的数据集允许在不同算法、技术或方法之间进行公平客观的比较。研究人员可以
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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