GSE9536：ß-Catenin通路在局灶性结节性增生中过表达但在肝硬化FNH样结节中不过表达

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE9536

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数据说明

局灶性结节性增生（FNH）是良性肝脏病变，被认为是正常肝脏中血流增加所引起的增生性反应。相比之下，FNH样结节发生于肝硬化肝脏，但具有相似的组织病理学特征。为更好地理解FNH的病理生理学，我们进行了转录组学分析。方法：采用Affymetrix芯片和cDNA微阵列比较8例FNH与6例正常肝脏组织的基因表达。选取的基因在70例良性肝脏肿瘤（包括腺瘤、肝硬化和FNH样病变）中通过定量RT-PCR进行验证。结果：在FNH中失调的基因中，有19个在正常肝小叶中具有生理性分区分布。所有6个静脉周围基因在FNH中上调，而通常表达于门管区周围的13个基因则下调。免疫组织化学显示谷氨酰胺合成酶显著过表达，形成通常以可见静脉为中心的网络状区域。ß-catenin mRNA轻度但显著过表达，若干已知的ß-catenin靶基因亦如此。

此外，在无激活突变的情况下，活化的低磷酸化ß-catenin蛋白在FNH中积累。这些结果表明ß-catenin通路在FNH中呈区带性特异性激活，而其他良性肝细胞肿瘤（包括FNH样病变）则表现出完全不同的ß-catenin表达模式。结论：在FNH中，ß-catenin通路表达增高仅限于扩大的门静脉周围区域，这可能解释了病灶起源处肝细胞的轻度多克隆性过度增殖。FNH样结节可能具有不同的发病学起源。关键词：疾病状态分析

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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