HNF1-alpha失活独立于SREBP1和ChREBP激活促进人肝细胞腺瘤脂肪生成

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE7473

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数据说明

在50%的肝细胞腺瘤（HCA）中，鉴定出转录因子1基因（TCF1）的双等位基因失活突变，该基因编码肝细胞核因子1α（HNF1α），其表型特征为显著的脂肪变性。为理解这种异常脂质储存的分子基础，我们进行了微阵列转录组分析，并通过定量RT-PCR、蛋白质印迹和脂质谱分析加以验证。在突变型HCA中，我们显示糖异生受抑制，并与糖酵解、柠檬酸穿梭和脂肪酸合成的激活相协调，预测脂质生成速率升高。此外，L-FABP的强烈下调提示脂肪酸转运受损也可能促成脂肪表型。另外，对非HNF1α突变型HCA以及非肿瘤肝脏中观察到的失调基因进行转录谱分析，使我们能够定义HNF1α突变型HCA的特异性特征。在这些肿瘤中，根据脂肪酸合成途径中鉴定的转录失调，脂质组成发生了显著改变。

令人惊讶的是，脂肪生成激活并非通过受抑制的SREBP-1和ChREBP发挥作用。我们得出结论，HNF1a突变型HCA中的脂肪变性主要源于脂肪生成的异常促进，这与HNF1a失活相关，且独立于SREBP-1和ChREBP的激活。最后，我们的发现具有潜在的临床意义，因为脂肪生成可以通过靶向治疗有效抑制。关键词：疾病状态分析

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。