Ketohexokinase缺失对肝脏和小肠转录组的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE331146

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

膳食果糖是驱动代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）和肝细胞癌（HCC）进展的主要风险因素。然而，果糖诱导的营养感应通路尚不清楚。在此，我们报道果糖通过KHK/PKM2/HIF-2α轴促进铁吸收，驱动MASH/HCC的发展。与葡萄糖相比，果糖异常稳定肠道HIF-α；这一效应可被KHK抑制剂和Khk基因缺失所消除。有趣的是，Khk缺陷小鼠中降低的HIF-α稳定性可被丙酮酸激酶M2（PKM2）的小分子抑制剂所恢复。相反，Khk缺陷小鼠表现出自发性全身性铁缺乏，其特征为低色素性贫血和血液中性粒细胞数量显著减少。此外，Khk缺陷以HIF-2α依赖的方式抑制铁吸收。最后，果糖以铁依赖的方式促进MASH/HCC进展。本研究揭示了膳食果糖的一种独特的营养感应通路，该通路具有治疗靶向性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。