人肝细胞癌及癌旁非肿瘤肝组织单细胞RNA测序揭示病因相关与病因无关的肿瘤微环境特征
该数据集来自 NCBI GEO(GSE326201),包含人肝细胞癌及癌旁非肿瘤肝组织的单细胞 RNA 测序数据,文件为 GSE326201_series_matrix.txt.gz,共 1 个文件

基本信息
资源简介
人肝细胞癌及癌旁非肿瘤肝组织单细胞RNA测序揭示病因相关与病因无关的肿瘤微环境特征
Single-cell RNA sequencing of human hepatocellular carcinoma and adjacent non-tumour liver tissues reveals etiology-associated and etiology-independent tumour microenvironmental features
该数据集来自 NCBI GEO(GSE326201),包含人肝细胞癌及癌旁非肿瘤肝组织的单细胞 RNA 测序数据,文件为 GSE326201_series_matrix.txt.gz,共 1 个文件。研究旨在单细胞分辨率下解析 HCC 及其周围肝脏微环境的细胞结构,覆盖恶性、免疫、基质及肝实质细胞群体,可用于考察 HCC 肿瘤微环境中共享的与病因相关的特征(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 27 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):肝细胞癌(HCC)发生于多种病因背景之下,但肿瘤微环境在多大程度上由病因相关程序与病因无关程序塑造,仍未被完全理解。本数据集旨在支持在单细胞分辨率下探究人 HCC 及周围肝脏微环境的细胞结构。通过分析肿瘤与癌旁非肿瘤肝组织,该研究为检查恶性、免疫、基质和肝实质细胞群体,以及研究 HCC 肿瘤微环境中共享的和与病因相关的特征提供了资源。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肝癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE326201
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 25 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
肝细胞癌(HCC)发生于多种病因背景之下,然而肿瘤微环境在多大程度上由病因相关程序与病因无关程序所塑造,目前仍未完全阐明。本数据集旨在支持在单细胞分辨率下探究人HCC及其周围肝脏微环境的细胞结构。通过对肿瘤及邻近非肿瘤肝组织进行分析,该研究为检查恶性细胞、免疫细胞、基质细胞和肝实质细胞群体,以及研究HCC肿瘤微环境中共享特征和病因相关特征提供了资源。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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