苯丙氨酸重编程MASH-HCC中TLS成熟与浆细胞分化 [scRNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318724

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）是肝细胞癌（HCC）一个快速增长的病因，并与不良临床结局及对免疫检查点抑制剂反应有限相关。新出现的证据表明，肿瘤微环境内的免疫失调促进了疾病进展；然而，区分MASH相关HCC与非MASH HCC的转录程序仍未完全明确。为填补这一空白，我们对从MASH和非MASH肿瘤组织中分离的总RNA进行了bulk RNA测序。该数据集的生成旨在实现对与MASH驱动肝癌发生相关的肿瘤内在及免疫相关通路进行比较转录组分析，尤其与免疫组织、代谢应激反应及肿瘤-免疫相互作用相关。所得RNA-seq数据为研究可能导致MASH-HCC免疫功能障碍的免疫细胞相关基因特征、代谢通路及微环境特征的改变提供了资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。