NRasG12V/myrAKT驱动肝癌中Sepp1敲低与补硒的单细胞转录组

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE317333

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肝细胞癌(HCC)的免疫微环境受到肿瘤浸润中性粒细胞的强烈影响，而中性粒细胞的功能异质性和调控机制仍未完全明确。由硒蛋白P(Sepp1)介导的硒代谢在肝脏的氧化还原稳态和免疫调节中发挥重要作用。本研究在对照或补硒条件下，构建了Ras/AKT驱动且Sepp1敲低的小鼠HCC模型。采用10x Genomics Chromium平台进行单细胞RNA测序，以分析肿瘤组织及相关肿瘤微环境，重点关注中性粒细胞群体。该数据集可用于系统分析HCC中与硒代谢和免疫调节通路相关的中性粒细胞转录状态。这些数据为在单细胞分辨率下研究Sepp1表达改变和硒可用性如何塑造肿瘤-免疫相互作用提供了资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。