OLFM2B 敲除对肝细胞癌恶性表型及机制的影响
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 OLFM2B 敲除对肝细胞癌恶性表型及机制的影响,属于肿瘤/肝癌分类,采用高通量测序表达谱,平台为 GPL34284,物种为 9606

基本信息
资源简介
OLFM2B 敲除对肝细胞癌恶性表型及机制的影响
Effects of OLFM2B knockout on malignant phenotypes and underlying mechanisms in Hepatocellular Carcinoma
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 OLFM2B 敲除对肝细胞癌恶性表型及机制的影响,属于肿瘤/肝癌分类,采用高通量测序表达谱,平台为 GPL34284,物种为 9606。数据仅含 1 个文件 GSE315394_series_matrix.txt.gz,作者为 Cunliang Deng。源站描述显示,敲低 OLFML2B 可抑制 HCC 细胞体外和体内恶性表型,抑制增殖、迁移、侵袭和 EMT,促进凋亡并损伤血管生成,机制上与 PI3K/AKT 通路及增殖、EMT、缺氧等致癌特征相关。该数据可用于研究 OLFML2B 在肝癌中的功能与分子机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Dec 31 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):OLFML2B 已被鉴定为多种癌症中的潜在癌基因,但其在肝细胞癌(HCC)中的功能作用和分子机制仍不清楚。在此,我们报告敲低 OLFML2B 可显著抑制 HCC 细胞在体外和体内的恶性表型。具体而言,OLFML2B 缺失抑制细胞增殖、迁移、侵袭和上皮-间质转化(EMT),同时促进凋亡并损害血管生成。在机制上,转录组和生物信息学分析将高 OLFML2B 表达与 PI3K/AKT 通路激活以及包括增殖、EMT 和缺氧在内的关键致癌特征联系起来。这些发现通过 Western blot 和 qPCR 得到证实,显示 OLFML2B 敲低后 PI3K/AKT 信号和 EMT 标志物下调。值得注意的是,OLFML2B 沉默的 HCC 细胞表现出对索拉非
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/肝癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE315394
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 02 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
OLFML2B已被确认为多种癌症中的潜在致癌基因,但其在肝细胞癌(HCC)中的功能作用和分子机制仍不清楚。在此,我们报道敲低OLFML2B可显著抑制HCC细胞在体外和体内的恶性表型。具体而言,OLFML2B缺失抑制了细胞增殖、迁移、侵袭和上皮-间充质转化(EMT),同时促进凋亡并损害血管生成。在机制上,转录组学和生物信息学分析将OLFML2B高表达与PI3K/AKT通路的激活以及包括增殖、EMT和缺氧在内的关键致癌特征联系起来。这些发现通过Western blot和qPCR得到证实,显示OLFML2B敲低后PI3K/AKT信号传导和EMT标志物下调。值得注意的是,OLFML2B沉默的HCC细胞对索拉非尼、瑞戈非尼和卡博替尼表现出增强的敏感性。在临床上,OLFML2B高表达预示TCGA-LIHC队列中更差的总生存期、疾病特异性生存期、无进展生存期和无病生存期,其预后价值在主要临床亚组中保持一致。
总体而言,我们的结果确立了OLFML2B通过PI3K/AKT通路驱动HCC进展和化疗耐药的关键作用,支持其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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