肿瘤花生四烯酸合成损害CXCR6+组织驻留记忆CD8+ T细胞代谢适应性并驱动肝细胞癌免疫治疗耐药
该数据集来自 NCBI GEO,编号 GSE308841,聚焦肝细胞癌(HCC)肿瘤微环境中脂质代谢重编程与免疫抑制的关系

基本信息
资源简介
肿瘤花生四烯酸合成损害CXCR6+组织驻留记忆CD8+ T细胞代谢适应性并驱动肝细胞癌免疫治疗耐药
Tumor arachidonic acid synthesis impairs metabolic fitness of CXCR6+ resident memory CD8+ T cells and drives immunotherapy resistance in hepatocellular carcinoma
该数据集来自 NCBI GEO,编号 GSE308841,聚焦肝细胞癌(HCC)肿瘤微环境中脂质代谢重编程与免疫抑制的关系。研究通过 CRISPR-Cas9 代谢基因筛选,发现经限速酶 FADS1 合成的花生四烯酸(ARA)作为致癌代谢物在肿瘤微环境中积累,抑制 FADS1 可提升 CD8+ T 细胞浸润与细胞毒性;ARA 通路负向调控肝组织驻留记忆 CD8+ T 细胞(CXCR6+ TRM),FADS1 过表达或 ARA 暴露会损害其抗肿瘤免疫并驱动免疫治疗耐药。数据含 1 个文件 GSE308841_series_matrix.txt.gz,可用于表达谱分析与代谢免疫机制研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 22 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):肝细胞癌(HCC)肿瘤微环境(TME)中的脂质代谢重编程驱动免疫抑制,但协调肿瘤-免疫串扰的关键介质仍不清楚。在此,我们鉴定出经限速酶 FADS1 合成的花生四烯酸(ARA)是一种新型致癌代谢物,其在 TME 中积累并促进肝癌发生。遗传或药理学抑制 FADS1 可降低 ARA 水平,从而增强 CD8+ T 细胞浸润和细胞毒性。通过对 T 细胞分化中的代谢基因进行 CRISPR-Cas9 筛选,我们发现 ARA 通路是肝驻留记忆 CD8+ T 细胞(TRM)的负调控因子。这些 CXCR6+ TRM 具有抗原特异性,但受 FADS1 过表达或 ARA 暴露损害,在肿瘤再攻击期间削弱抗肿瘤免疫。机制上,ARA 特异性破坏 IL-15 依赖的 meta
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34290、10090。本站分类:肿瘤/肝癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308841
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 01 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
肝细胞癌(HCC)肿瘤微环境(TME)中的脂质代谢重编程驱动免疫抑制,然而协调肿瘤-免疫串扰的关键介质仍不明确。在此,我们鉴定出通过限速酶FADS1合成的花生四烯酸(ARA)作为一种新型肿瘤代谢物,其在TME中蓄积并促进肝癌发生。FADS1的遗传或药理学抑制可降低ARA水平,从而增强CD8+ T细胞浸润和细胞毒性。通过对T细胞分化中代谢基因的CRISPR-Cas9筛选,我们揭示ARA通路是肝脏驻留记忆CD8+ T细胞(TRM)的负调控因子。这些CXCR6+ TRM表现出抗原特异性,但受FADS1过表达或ARA暴露的损害,在肿瘤再攻击期间削弱抗肿瘤免疫。在机制上,ARA特异性破坏CXCR6+ TRM中IL-15依赖性代谢适应性。在治疗上,靶向FADS1-ARA轴与抗PD-1和GPC3-CAR-T疗法协同作用。因此,我们的研究为ARA富集的免疫抑制性TME确定了一个有前景的靶点,旨在提高HCC免疫疗法的有效性。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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