PABPN1-C5 轴通过 NF-kB 激活促进肝细胞癌进展

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE289702

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

RNA多聚腺苷酸化是一种关键的转录后修饰，对基因表达调控至关重要。然而，多聚腺苷酸化及其关键分子——多聚腺苷酸结合蛋白核1（PABPN1）在肝细胞癌（HCC）中的作用和机制仍知之甚少。本研究探讨了PABPN1及其调控基因在HCC进展中的作用，以确定潜在的治疗靶点。对癌症基因组图谱（TCGA）数据集和一个独立HCC队列的分析显示，PABPN1在HCC患者中显著上调，且与不良预后相关。利用HCC细胞系和条件性敲除小鼠模型进行的功能缺失研究表明，靶向PABPN1可抑制HCC进展。相反，PABPN1过表达在体外和水动力转染肝癌发生小鼠模型中促进了HCC的发展。机制研究表明，PABPN1调节C5 mRNA的多聚腺苷酸化和稳定性，PABPN1-C5轴驱动NF-kB激活并招募多形核髓源性抑制细胞（PMN-MDSCs）以促进HCC进展。

使用C5a受体抑制剂CCX168对PABPN1-C5轴进行治疗性靶向，在体外和体内模型中均显著抑制了HCC的进展。本研究确定了PABPN1作为HCC发展的关键调节因子，并揭示了癌症中补体成分的转录后调控机制。靶向PABPN1-C5轴代表了一种有前景的HCC治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。