表达HBsAg与IL-15的工程化溶瘤水疱性口炎病毒增强乙肝阳性肝细胞癌免疫激活与肿瘤杀伤(scRNA-Seq)

该数据集来自NCBI GEO,包含表达HBsAg与IL-15的工程化溶瘤水疱性口炎病毒(rVSVM51R)在乙肝阳性肝细胞癌中的单细胞RNA测序数据,文件为GSE276716_series_matrix.txt.gz

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基因组分类GPL2424710090疫苗编码
GSE276716: Engineered Oncolytic Vesicular Stomatitis Virus Expressing HBsAg and IL-15 Enhances Immune Activation and Tumor Killing in Hepatitis B-Positive Hepatocellular Carcinoma (scRNA-Seq)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

表达HBsAg与IL-15的工程化溶瘤水疱性口炎病毒增强乙肝阳性肝细胞癌免疫激活与肿瘤杀伤(scRNA-Seq)

Engineered Oncolytic Vesicular Stomatitis Virus Expressing HBsAg and IL-15 Enhances Immune Activation and Tumor Killing in Hepatitis B-Positive Hepatocellular Carcinoma (scRNA-Seq)

该数据集来自NCBI GEO,包含表达HBsAg与IL-15的工程化溶瘤水疱性口炎病毒(rVSVM51R)在乙肝阳性肝细胞癌中的单细胞RNA测序数据,文件为GSE276716_series_matrix.txt.gz。研究通过体外与小鼠模型评估该重组病毒的肿瘤靶向性、抗肿瘤效果及免疫激活作用,可用于探索溶瘤病毒联合治疗肝细胞癌的免疫机制、肿瘤微环境变化及潜在治疗靶点(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 09 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肝细胞癌(HCC)是全球最常见且致死率最高的癌症之一,慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染是其重要风险因素。由于肿瘤异质性、免疫浸润有限、微环境复杂等因素,HCC治疗具有挑战性。为克服这些挑战,我们将溶瘤病毒载体与治疗性疫苗和抗肿瘤细胞因子相结合。构建了一种表达乙型肝炎表面抗原(HBsAg)和IL15的重组水疱性口炎病毒(rVSVM51R)。在培养皿中,rVSVM51R特异性破坏HCC细胞,对原代小鼠肝细胞毒性极小,表现出肿瘤靶向特异性。与对照VSVM51R-GFP相比,rVSVM51R-S在同系移植和基因工程HBV阳性HCC小鼠模型中显示出更好的抗肿瘤效果,表现为肿瘤减少

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/肝癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE276716

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 01 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肝细胞癌(HCC)是全球范围内最常见且致死率最高的癌症之一,慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染是其重要的危险因素。由于肿瘤异质性、免疫浸润有限、微环境复杂等因素,HCC的治疗极具挑战性。为克服这些挑战,我们将溶瘤病毒载体与治疗性疫苗及抗肿瘤细胞因子相结合。我们构建了一种表达乙型肝炎表面抗原(HBsAg)和IL15的重组水疱性口炎病毒(rVSVM51R)。在培养皿中,rVSVM51R特异性破坏HCC细胞,而对原代小鼠肝细胞毒性极小,展现出肿瘤靶向特异性。与对照VSVM51R-GFP相比,rVSVM51R-S在同系移植和基因工程HBV阳性HCC小鼠模型中表现出更好的抗肿瘤效果,具体表现为肿瘤缩小和HBsAg特异性T细胞反应的激活。此外,表达HBsAg、小鼠IL15及IL15Rα sushi结构域的rVSVM51R-S-mIL15-Ra,其抗肿瘤活性强于rVSVM51R-mIL15-Ra或rVSVM51R-S。

肿瘤再挑战实验表明,rVSVM51R-S-mIL15-Ra能够提供持久、长期的肿瘤控制。单细胞RNA测序显示,工程化VSV增加了巨噬细胞、Th1和记忆CD4+、效应CD8+ T细胞的肿瘤浸润,并增强了肿瘤杀伤。细胞清除实验进一步证实了巨噬细胞、CD4+和CD8+ T细胞在肿瘤抑制中的关键作用。值得注意的是,表达人超级激动剂IL15的rVSVM51R-S-hIL15-Ra的有效性在人源化小鼠模型中得到了验证。总体而言,我们的数据表明,这种工程化的多功能溶瘤病毒能够实现特异性杀伤、免疫激活和微环境调节。该策略在HBV阳性HCC的免疫治疗中具有重要前景,并可扩展至其他肿瘤类型。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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