GSE272343：抑制Fxr破坏胆汁酸代谢引发YAP激活诱导的肝细胞癌

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272343

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数据说明

胆汁酸（BA）的生成是肝脏的一项关键代谢功能，其紊乱会导致包括肝细胞癌（HCC）在内的多种肝脏疾病。然而，其潜在的分子机制一直不甚明确。在此，我们报道BA代谢直接受YAP一种此前未被识别的抑制功能的调控，YAP是一种已知促进HCC形成的转录激活因子。我们在肝细胞中显示，活化的YAP抑制Fxr，后者是一种BA感应核受体，对BA的生成和外排起关键调控作用。活化YAP的抑制功能诱导胆汁淤积，损伤肝脏，并改变肝脏和血清中BA的浓度与组成。具体而言，YAP活化抑制了Fxr靶基因Bsep（Abcb11）的表达，损害BA外排并损伤肝细胞。肝细胞损伤导致血液中BA升高，进而进一步激活肝脏YAP，形成导致HCC的恶性循环。在小鼠肝脏和人类HCC患者样本中，转录组分析显示YAP与Fxr活性呈负相关。

在机制上，研究发现Fxr以不依赖DNA结合的方式与Teads结合；Teads将YAP招募至Fxr，通过用组蛋白去乙酰化酶HDAC1替换组蛋白乙酰转移酶P300，对Fxr进行表观遗传重编程。重要的是，通过使用Fxr激动剂GW4064激活Fxr、使用Entinostat抑制HDAC1或过表达Bsep来减轻YAP在胆汁酸代谢中的抑制功能，可减少包括肝损伤、纤维化和炎症在内的胆汁淤积表型，从而缓解由YAP激活所致的HCC。我们的结果确定了Yap的转录抑制因子作用是Yap诱导HCC的关键驱动因素，并表明胆汁酸代谢是HCC的潜在治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。