烟酸诱导组蛋白烟酰化通过调控PPFIA1基因表达抑制肝细胞癌转移

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE229949

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数据说明

组蛋白翻译后修饰（PTMs）通过转录调控控制基因表达谱。异常的组蛋白PTMs染色质结构导致基因表达失调和癌症进展。烟酸（维生素B3或维生素PP），作为十三种必需维生素之一，具有广泛的用途，有助于消化系统、皮肤和神经系统的功能。在此，我们发现烟酸（NA）诱导组蛋白和非组蛋白赖氨酸烟酰化，并在HeLa细胞的核心组蛋白上鉴定出17个烟酰化位点。此外，NA衍生的组蛋白赖氨酸残基烟酰化是一种表观遗传修饰，通过生成烟酰辅酶A改变染色质可及性来调控基因转录。Knic通过抑制其与转录因子HOXB9的结合来失活癌基因PPFIA1的转录，而PPFIA1被发现对促进细胞在细胞外基质上的铺展具有重要作用，并且是人乳腺肿瘤细胞迁移和侵袭所必需的。然而，PPFIA1控制肝细胞癌（HCC）发生和发展的作用及分子机制尚不清楚。

在此，我们证明PPFIA1在体内和体外促进HCC的增殖、迁移、侵袭和肿瘤发生。值得注意的是，PPFIA1在多种人类癌包括HCC中的表达上调。我们的研究还表明，PPFIA1是未来HCC治疗策略中NA的一个有前景的潜在靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。