GSE212529:MTFR2 在肝细胞癌中塑造免疫微环境屏障

数据整合了八种 HCC 细胞系的 MTFR2 分析,以及来自 bulk HCC 组织的三个数据集(公共数据集、真实世界数据集、免疫治疗数据集),并包含生存与免疫治疗数据

geo
浏览 8
基因组分类GPL167919606
GSE212529: MTFR2 shapes a barrier of immune microenvironment in hepatocellular carcinoma

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-13

资源简介

GSE212529:MTFR2 在肝细胞癌中塑造免疫微环境屏障

MTFR2 shapes a barrier of immune microenvironment in hepatocellular carcinoma

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 MTFR2 shapes a barrier of immune microenvironment in hepatocellular carcinoma,聚焦肝细胞癌(HCC)中 MTFR2 的作用。数据整合了八种 HCC 细胞系的 MTFR2 分析,以及来自 bulk HCC 组织的三个数据集(公共数据集、真实世界数据集、免疫治疗数据集),并包含生存与免疫治疗数据。可用于研究 MTFR2 表达与预后、免疫细胞浸润、免疫检查点及免疫治疗反应预测通路之间的关系,以及其在肿瘤-免疫循环中的角色。文件为 GSE212529_series_matrix.txt.gz,共 1 个文件(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 01 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肝细胞癌(HCC)是全球癌症相关死亡的主要原因之一。线粒体分裂调节因子 2(MTFR2)参与多种癌症的发生发展。然而,MTFR2 在 HCC 中的作用仍不清楚。在本研究中,我们对 HCC 中的 MTFR2 进行了全面分析,该分析基于对八种 HCC 细胞系的整合性 MTFR2 分析,以及来自 bulk HCC 组织的三个数据集(公共数据集、真实世界数据集、免疫治疗数据集)所衍生的生存和免疫治疗数据。我们证明 MTFR2 的表达水平在 HCC 中上调,导致预后不良。MTFR2 与免疫细胞浸润水平、多种免疫检查点及免疫治疗反应预测通路呈正相关,并在肿瘤-免疫循环中发挥重要作用。总之,我们的工作表明 MTFR2 可以塑造免疫微环境屏障

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL16791、9606。本站分类:肿瘤/肝癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE212529

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 07 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE212529

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肝细胞癌(HCC)是全球癌症相关死亡的主要原因之一。线粒体裂变调节因子2(MTFR2)参与多种癌症的发展。然而,MTFR2在HCC中的作用仍不清楚。在本研究中,我们对HCC中的MTFR2进行了全面分析,该分析基于对八种HCC细胞系的综合性MTFR2分析,以及来自HCC组织批量数据、生存数据和免疫治疗数据的三套数据集(公共数据集、真实世界数据集、免疫治疗数据集)。我们证明,MTFR2在HCC中表达水平上调,导致预后不良。MTFR2与免疫细胞浸润水平、多种免疫检查点及免疫治疗反应预测通路呈正相关,并在肿瘤-免疫循环中发挥重要作用。总之,我们的工作表明,MTFR2可塑造免疫微环境屏障并导致肝细胞癌预后不良,但该免疫屏障可能被免疫治疗打破。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案