小鼠HCC模型中FAD亚型的鉴定

该数据集来自 NCBI,聚焦小鼠肝细胞癌(HCC)模型中脂肪酸降解(FAD)相关亚型的转录组特征。研究基于临床样本中 42 个 FAD 基因建立的 HCC 分子分型,并检索 PubMed 获取小鼠模型 RNA 测序数据,共纳入来自五个公开数据集的 90 个样本,涵盖 11 种小鼠 HCC 模型,另加

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基因组分类GPL2424710090
GSE202070: Identification of FAD subtypes in mouse HCC models

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-13

资源简介

小鼠HCC模型中FAD亚型的鉴定

Identification of FAD subtypes in mouse HCC models

该数据集来自 NCBI,聚焦小鼠肝细胞癌(HCC)模型中脂肪酸降解(FAD)相关亚型的转录组特征。研究基于临床样本中 42 个 FAD 基因建立的 HCC 分子分型,并检索 PubMed 获取小鼠模型 RNA 测序数据,共纳入来自五个公开数据集的 90 个样本,涵盖 11 种小鼠 HCC 模型,另加入本课题组两个小鼠模型(NRAS.MYC.ND 和 AKT1.MYC.KD)的 8 个样本转录组测序数据。数据可用于探索这两个模型的转录组特征,并支持 HCC 中 FAD 亚型的分类与验证研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 02 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在本研究中,我们基于临床样本中的 42 个脂肪酸降解(FAD)基因,鉴定并验证了肝细胞癌(HCC)的一种分子分型。我们进一步检索 PubMed 以获取小鼠模型的 RNA 测序数据集,从而鉴定小鼠 HCC 模型中的 FAD 亚型。共从五个公开数据集中收集了 90 个样本,包括 11 种小鼠 HCC 模型。此外,还纳入了来自我们两个小鼠模型(NRAS.MYC.ND 和 AKT1.MYC.KD)的 8 个样本的转录组测序数据。该数据集旨在探索这两个模型的转录组特征。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/肝癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE202070

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 05 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中,我们在临床样本中基于42个脂肪酸降解(FAD)基因识别并验证了肝细胞癌(HCC)的一种分子分型。我们进一步在PubMed中检索了小鼠模型的RNA测序数据集,以识别小鼠HCC模型中的FAD亚型。我们共从五个公开可用的数据集中收集了90个样本,其中包括11个小鼠HCC模型。此外,我们还纳入了来自我们两个小鼠模型(NRAS.MYC.ND和AKT1.MYC.KD)的8个样本的转录组测序数据。该数据集旨在探究这两个模型的转录组特征。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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