GSE178201：致癌基因组计划

资源简介

GSE178201：致癌基因组计划

GSE178201 即“致癌基因组计划”（The Carcinogenome Project）数据集，来源于 ncbi.nlm.nih.gov，在本站归类于肿瘤 / 肝癌方向。该资源围绕化学物质的致癌性与遗传毒性展开，构建了一个规模较大的毒理基因组学表达谱集合，共包含约 11000 个表达谱，对应约 500 种化学物质。每种化学物质均带有致癌性和遗传毒性注释，并在 HepG2（人肝细胞癌细胞系）与 MCF10A 细胞中，于多个剂量和重复条件下完成表达谱分析。数据集以芯片表达谱分析为主要类型，涉及 GPL20573 平台与人类物种（9606），作者为 Stefano、Monti，发布时间为 Jun 15 202。整体而言，它为研究化学暴露与肿瘤相关细胞反应之间的关系提供了系统性的表达谱资源。

【数据集背景】

该数据集源自“致癌基因组计划”，其目标在于建立大规模毒理基因组学资源，将化学物质的暴露与细胞表达谱变化联系起来，并辅以致癌性和遗传毒性信息。由于所采用的细胞模型包括 HepG2（人肝细胞癌细胞系）和 MCF10A，该资源在肿瘤生物学、尤其是肝癌相关研究中具有潜在价值。本站将其归入肿瘤 / 肝癌分类，也反映了其在肿瘤毒理基因组学方向的应用定位。数据集的作者为 Stefano、Monti，发布时间为 Jun 15 202。

【数据内容】

数据集包含约 11000 个表达谱，对应约 500 种化学物质。每一种化学物质都标注了致癌性和遗传毒性信息。表达谱分析在 HepG2（人肝细胞癌细胞系）和 MCF10A 细胞中进行，并覆盖多个剂量和重复条件。主题标签包括 Expression profiling by array、GPL20573 和 9606，说明其属于芯片表达谱分析，平台编号为 GPL20573，物种为人类。文件数量为 1，文件样例为 GSE178201_series_matrix.txt.gz。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“The Carcinogenome Project”。数据集英文名为 GSE178201: The Carcinogenome Project。作者为 Stefano、Monti，发布时间为 Jun 15 202。关于样本采集、实验处理、剂量设置、重复次数等更细粒度的实验设计信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于毒理基因组学与肿瘤相关研究，尤其是围绕化学物质致癌性、遗传毒性以及表达谱响应关系的分析。由于包含 HepG2（人肝细胞癌细胞系）和 MCF10A 细胞在多个剂量和重复条件下的表达谱，可用于比较不同化学物质在相同细胞模型中的表达变化模式，也可用于结合致癌性和遗传毒性注释开展分组或关联性探索。本站分类为肿瘤 / 肝癌，因此也可作为肝癌相关细胞模型表达谱研究的参考资源。具体分析场景需结合数据实际内容与实验设计进行判断，源站未提供更详细的适用建议。

【使用方法】

可下载数据文件 GSE178201_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包，应按文件格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以避免因字段解析或编码问题导致后续分析错误。关于更具体的读取代码、预处理步骤或分析流程，源站未提供。

【质量与限制】

数据集包含约 11000 个表达谱、约 500 种化学物质，并在 HepG2 和 MCF10A 细胞中于多个剂量和重复条件下进行表达谱分析，且每种化学物质均标注了致癌性和遗传毒性信息。这些信息有助于评估数据的覆盖范围与注释完整性。然而，关于数据质量评估、批次效应、缺失值情况、标准化方法以及具体限制，源站未提供。文件数量为 1，使用前应自行核对数据完整性与字段一致性。

【引用与许可】

作者为 Stefano、Monti，发布时间为 Jun 15 202。来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“The Carcinogenome Project”。关于引用格式、许可条款或使用限制，源站未提供。