Prominin 1+细胞在肝损伤与肝癌中的命运及功能作用[scRNA-seq]
该数据集来自NCBI GEO，标题为Prominin 1+细胞在肝损伤与肝癌中的命运及功能作用[scRNA-seq]，属于肿瘤/肝癌分类
![GSE152707: Fate and Functional Roles of Prominin 1+ Cells in Liver Injury and Cancer [scRNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/214878.jpg)
基本信息
资源简介
Prominin 1+细胞在肝损伤与肝癌中的命运及功能作用[scRNA-seq]
GSE152707 是一个来自 NCBI GEO 的单细胞 RNA 测序数据集，英文标题为“Fate and Functional Roles of Prominin 1+ Cells in Liver Injury and Cancer [scRNA-seq]”，中文可译为“Prominin 1+ 细胞在肝损伤与肝癌中的命运及功能作用”。该数据集归入肿瘤/肝癌分类，聚焦小鼠肝癌中 Prom1+ 细胞的基因表达特征，旨在单细胞水平上刻画这类细胞的表达谱。数据集由 Raymond、Wu 提交，发布时间为 Jun 17 202，包含 1 个数据文件，样例文件名为 GSE152707_series_matrix.txt.gz。整体而言，它为研究 Prominin 1 阳性细胞在肝脏损伤与肿瘤发生过程中的状态与作用提供了单细胞转录组层面的数据资源。
【数据集背景】
该数据集的研究目标是在单细胞水平上理解小鼠肝癌中 Prom1+ 细胞的基因表达谱。Prominin 1（Prom1）阳性细胞在肝损伤与肝癌中的命运和功能作用是该研究关注的核心问题。数据集标题同时涵盖肝损伤与癌症两个情境，说明其研究背景涉及肝脏在损伤应答与肿瘤形成过程中特定细胞群体的行为。数据集被归类为肿瘤/肝癌方向，主题标签包含“Expression profiling by high throughput sequencing”，表明其采用高通量测序进行表达谱分析。物种信息以 NCBI Taxonomy 编号 10090 标注，对应小鼠；平台信息标注为 GPL21103。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件，样例文件为 GSE152707_series_matrix.txt.gz，属于 GZIP 压缩格式。该文件为系列矩阵文件，通常用于承载该系列样本的表达数据及相关样本信息。数据集的主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL21103 和 10090，分别指向高通量测序表达谱、芯片/测序平台编号以及小鼠物种分类。除上述文件与标签信息外，源站未提供更细的样本数量、细胞数、基因数或分组设计等具体内容。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI GEO（ncbi.nlm.nih.gov），源站标题与数据集英文名一致，均为“Fate and Functional Roles of Prominin 1+ Cells in Liver Injury and Cancer [scRNA-seq]”。提交者为 Raymond、Wu，发布时间为 Jun 17 202。源站描述说明该研究的目标是理解小鼠肝癌中 Prom1+ 细胞的单细胞水平基因表达谱。关于样本采集的具体组织来源、实验处理、测序策略与建库细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于在单细胞转录组层面考察小鼠肝癌中 Prom1+ 细胞基因表达特征的研究场景，也可用于围绕肝损伤与肝癌背景下 Prominin 1 阳性细胞命运与功能作用开展探索性分析。由于其分类归属肿瘤/肝癌，并带有高通量测序表达谱标签，适合作为肝癌单细胞表达谱研究的参考数据。具体可支持的比较分析、细胞分群或功能推断范围，需以实际数据内容为准；源站未提供更详细的适用性说明。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE152707_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以避免因字段解析或编码差异导致批量处理出错。关于该系列矩阵文件的具体字段含义、是否需要配套注释文件以及推荐的分析流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅有 1 个文件，样例为系列矩阵文件，源站未提供样本量、测序深度、细胞质量控制指标或数据完整性说明。数据发布时间标注为 Jun 17 202，年份信息不完整。由于缺乏详细的方法与质控描述，使用前应自行核查数据字段与编码，并在小样本验证的基础上再开展批量分析。源站未提供其他质量评估结论。
【引用与许可】
该数据集的提交者为 Raymond、Wu，来源站为 NCBI GEO。关于引用方式、许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE152707
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
目的：本研究旨在单细胞水平上了解小鼠肝癌中Prom1+细胞的基因表达谱。方法：用胶原酶灌注Col1a1Cre;Rosa26mTmG小鼠的DEN-WAD肝脏。通过FACS分选GFP+UV-细胞。使用10X chromium技术的10X单基因表达v3构建单细胞文库。结论：我们鉴定了Prom1+Afp+、Prom1+Afp-、Prom1-Afp+基因表达谱。这些基因表达谱揭示了先前观察到的肝肿瘤起始细胞和胆管细胞的标志物。此外，它们还揭示了新的特异性标志物。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
