GSE12886：沉默WT1表达对HCC转录组的影响

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数据说明

Wilms瘤1基因（WT1）编码一种参与细胞生长与发育的转录因子。正如我们此前所报道，WT1在正常肝组织中几乎检测不到表达，但在肝硬化中被诱导表达。尽管已发现WT1在多种恶性肿瘤中过表达，但其在肝癌发生中的作用尚未明确。我们发现WT1在包括PLC/PRF/5和HepG2在内的多种人肝细胞癌（HCC）细胞系中表达，并在42%患者的HCC肿瘤组织中表达。WT1小干扰RNA不影响HCC细胞的增殖速率，但消除了其对失巢凋亡的抵抗。对WT1敲低后PLC/PRF/5细胞的转录组分析显示，251个基因上调，321个基因下调。前者中90%对应于代谢基因，主要是那些表征成熟肝细胞表型的基因。相反，WT1抑制后表达下降的基因主要与抗凋亡防御、细胞周期和肿瘤进展相关。与这些发现一致，WT1表达增加了肝肿瘤细胞对多柔比星的耐药性，多柔比星是一种用于治疗HCC的化合物。

有趣的是，多柔比星在HCC细胞和正常人肝细胞中均强烈增强了WT1的表达。在不同化疗药物中，WT1转录的诱导仅限于拓扑异构酶2抑制剂。当WT1表达被抑制时，多柔比星导致caspase-3活化显著增加。总之，WT1在相当比例的HCC中表达，促进肿瘤进展和化疗耐药，提示WT1可能是HCC治疗的重要靶点。关键词：细胞类型比较

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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