酒精性与丙型肝炎后肝硬化基因表达数据集
该数据集来自 NCBI,比较酒精性肝硬化、丙型肝炎后肝硬化与对照肝脏的基因表达谱。研究使用 cDNA 阵列进行转录组分析,在无肝细胞癌的肝硬化样本中筛选出可区分三组的 70 个转录本,而在肝细胞癌背景下未发现类似区分

基本信息
资源简介
酒精性与丙型肝炎后肝硬化基因表达数据集
Post-alcoholism and post-hepatitis C cirrhosis
该数据集来自 NCBI,比较酒精性肝硬化、丙型肝炎后肝硬化与对照肝脏的基因表达谱。研究使用 cDNA 阵列进行转录组分析,在无肝细胞癌的肝硬化样本中筛选出可区分三组的 70 个转录本,而在肝细胞癌背景下未发现类似区分。数据可用于研究肝硬化向肝癌进展中的转录失调(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 01 200。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究的目的是比较丙型肝炎病毒(HCV)后肝硬化和酒精性后肝硬化的基因表达谱。通过使用几乎覆盖肝脏中每个转录本的 cDNA 阵列进行转录组分析,我们比较了酒精性肝硬化、HCV 肝硬化和对照肝脏中的转录本水平。严格筛选鉴定出 70 个转录本,可完全区分 3 组患者(7 例 HCV 肝硬化、7 例酒精性肝硬化和 8 例对照肝脏)。相比之下,在肝细胞癌(HCC)背景下,比较 10 例 HCV 肝硬化、10 例酒精性肝硬化和 8 例对照肝脏未能鉴定出此类转录本。我们报告,转录水平的失调确实存在于无 HCC 的肝硬化中,并在可检测到的 HCC 之前短暂观察到。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL5215、9606。本站分类:肿瘤/肝癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE10356
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 19 201,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究的目的是比较丙型肝炎病毒(HCV)感染后肝硬化和酒精性肝硬化的基因表达谱。通过使用几乎涵盖肝脏中每个转录本的cDNA阵列进行转录组分析,我们比较了酒精性肝硬化、HCV肝硬化和对照肝脏中的转录本水平。经过严格筛选,鉴定出70个转录本的列表,这些转录本完全区分了3组患者(7例HCV肝硬化、7例酒精性肝硬化和8例对照肝脏)。相比之下,在肝细胞癌(HCC)背景下,比较10例HCV肝硬化、10例酒精性肝硬化和8例对照肝脏未能鉴定出此类转录本。我们报告,转录水平的失调确实存在于无HCC的肝硬化中,并在可检测到的HCC之前短暂观察到。关键词:病因依赖性和HCC依赖性分析
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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