肝细胞癌淋巴结转移固定组织基因表达谱数据集
该数据集来自 omicsdi.org，收录肝细胞癌（HCC）淋巴结转移相关固定组织的基因表达谱数据。研究从淋巴结阳性（n=20）或阴性（n=20）HCC 患者的配对瘤内与瘤周福尔马林固定标本中提取 RNA，共 80 份 RNA 样本，采用 cDNA 介导的退火、选择、延伸和连接（DASL） assa
基本信息
资源简介
肝细胞癌淋巴结转移固定组织基因表达谱数据集
该数据集来自 omicsdi.org，收录肝细胞癌（HCC）淋巴结转移相关固定组织的基因表达谱数据。研究从淋巴结阳性（n=20）或阴性（n=20）HCC 患者的配对瘤内与瘤周福尔马林固定标本中提取 RNA，共 80 份 RNA 样本，采用 cDNA 介导的退火、选择、延伸和连接（DASL） assay 检测 502 个已知癌症相关基因，以识别淋巴结转移组与非淋巴结转移组之间的差异表达基因。数据可用于肝癌淋巴结转移分子机制研究与差异表达分析（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：从淋巴结阳性（n=20）或阴性（n=20）HCC 患者的配对瘤内和瘤周组织的福尔马林固定标本中提取 RNA。使用包含 502 个已知癌症相关基因的芯片进行 cDNA 介导的退火、选择、延伸和连接 assay，以在 80 份 RNA 样本中识别差异表达基因。使用 High Pure RNA Paraffin Kit 按照制造商方案从组织标本中纯化总 RNA。通过使用 cDNA 介导的退火、选择、延伸和连接 assay，进行 DASL 实验以识别匹配的瘤内和瘤周组织中淋巴结转移（LNM）组与非淋巴结转移（NLNM）组之间差异表达的基因。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/肝癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-28248
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-28248
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
从淋巴结阳性（n=20）或阴性（n=20）HCC患者的配对瘤内和瘤周组织的福尔马林固定标本中提取RNA。采用cDNA介导的退火、选择、延伸和连接测定法，使用502个已知癌症相关基因的芯片，在80份RNA样本中鉴定差异表达基因。按照制造商的操作方案，使用High Pure RNA Paraffin Kit从组织标本中纯化总RNA。通过cDNA介导的退火、选择、延伸和连接测定法进行DASL实验，以鉴定配对的瘤内和瘤周组织中淋巴结转移（LNM）组与非淋巴结转移（NLNM）组之间差异表达的基因。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
