FIB-SEM数据集展示人肝癌细胞Huh-7中高尔基体基质蛋白GM130的定位
EMPIAR-11849 FIB-SEM数据集展示人肝癌细胞（Huh-7）中高尔基体基质蛋白GM130的定位 1.1 FIB-SEM数据集展示人肝癌细胞（Huh-7）中高尔基体基质蛋白GM130（紫色）的重建体积 TIFF 564 1 UNSIGNED
基本信息
资源简介
FIB-SEM数据集展示人肝癌细胞Huh-7中高尔基体基质蛋白GM130的定位
该数据集为一项聚焦人肝癌细胞（Huh-7）内高尔基体基质蛋白GM130定位的FIB-SEM三维成像数据，英文名称为“FIB-SEM dataset showing localization of a Golgi matrix protein GM130 in human hepatocellular carcinoma cell (Huh-7)”。数据来源于EMPIAR-11849，属于肿瘤/肝癌相关分类，原始来源站为ebi.ac.uk。数据集以重建体积形式提供，文件格式为TIFF，数据规模标注为564，数据类型为1 UNSIGNED。该数据集可用于观察GM130在Huh-7细胞中的空间分布，并支持基于FIB-SEM的高分辨率三维结构分析。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
该数据集围绕人肝癌细胞（Huh-7）中高尔基体基质蛋白GM130的定位展开。GM130是一种高尔基体基质蛋白，在细胞内膜系统与高尔基体结构组织中具有重要作用。通过FIB-SEM（聚焦离子束扫描电子显微镜）技术，研究者能够获取细胞内部结构的高分辨率三维信息，并在此基础上观察特定蛋白的定位关系。该数据集以Huh-7细胞为研究对象，属于肿瘤/肝癌相关数据分类，来源于EMPIAR-11849，原始来源站为ebi.ac.uk。源站描述指出，该数据集展示的是GM130（紫色）在人肝癌细胞（Huh-7）中的定位，并以重建体积形式提供。
【数据内容】
数据集的核心内容为FIB-SEM重建体积，展示人肝癌细胞（Huh-7）中高尔基体基质蛋白GM130的定位。根据源站描述，GM130以紫色标识，数据以TIFF格式提供，规模标注为564，数据类型为1 UNSIGNED。该数据属于三维重建体积数据，可用于观察GM130在细胞内的空间分布。除上述信息外，源站未提供更多关于数据内容、标注方式、样本数量或具体结构细节的说明。
【采集与来源】
该数据集来源于EMPIAR-11849，来源站为ebi.ac.uk。数据采集方式为FIB-SEM，即聚焦离子束扫描电子显微镜成像，用于获取人肝癌细胞（Huh-7）中高尔基体基质蛋白GM130定位的重建体积。源站描述中提及“reconstructed volumes TIFF 564 1 UNSIGNED”，表明数据以重建体积形式提供，文件格式为TIFF，规模为564，数据类型为1 UNSIGNED。除这些信息外，源站未提供关于采集设备参数、成像条件、样本制备流程或采集时间的更多细节。
【适用场景】
该数据集适用于需要观察人肝癌细胞（Huh-7）中高尔基体基质蛋白GM130定位的研究场景。由于数据以FIB-SEM重建体积形式提供，可用于三维结构分析、细胞器空间分布观察以及高尔基体相关蛋白定位研究。其肿瘤/肝癌分类也使其可用于肝癌细胞生物学相关研究。除上述基于数据内容的通用用途外，源站未提供关于具体应用案例、分析流程或研究结论的更多信息。
【使用方法】
该数据集以TIFF格式提供，规模标注为564，数据类型为1 UNSIGNED。使用者可依据TIFF格式的一般读取方式打开重建体积数据，并结合FIB-SEM三维成像的常规处理流程进行观察与分析。源站未提供关于具体软件、处理步骤、参数设置或分析流程的说明。
【质量与限制】
源站描述中提供了数据格式、规模和数据类型信息，即TIFF、564、1 UNSIGNED。除这些信息外，源站未提供关于数据分辨率、信噪比、缺失区域、重建完整性或其他质量指标的说明。因此，该数据集在质量与限制方面的具体信息源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于EMPIAR-11849，来源站为ebi.ac.uk。除来源标识外，源站未提供关于引用方式、许可条款或使用限制的更多信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/EMPIAR-11849
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
EMPIAR-11849 FIB-SEM dataset showing localization of a Golgi matrix protein GM130 in human hepatocellular carcinoma cell (Huh-7) 1.1 FIB-SEM dataset showing localization of a Golgi matrix protein GM130 (purple) in human hepatocellular carcinoma cell (Huh-7) reconstructed volumes TIFF 564 1 UNSIGNED
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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