健康肝与肝硬化肝成体干细胞克隆及肝癌活检全基因组测序数据集
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/肝癌分类，主题标签为 Genomics。数据涵盖健康肝脏与肝硬化肝脏（由酒精滥用、NASH 和 PSC 导致）中克隆扩增的肝成体干细胞克隆，以及肝癌活检样本，均经过全基因组测序
基本信息
资源简介
健康肝与肝硬化肝成体干细胞克隆及肝癌活检全基因组测序数据集
该数据集收录于 omicsdi.org，归类于肿瘤 / 肝癌方向，主题标签为 Genomics。其核心内容围绕肝脏成体干细胞的克隆扩增与肝癌发生过程中的突变影响展开：研究对象既包括健康肝脏中克隆扩增的肝成体干细胞克隆，也包括由酒精滥用、NASH 和 PSC 导致的肝硬化肝脏中克隆扩增的肝成体干细胞克隆，同时还纳入了肝癌活检样本。上述样本均经过全基因组测序，用以确定癌前肝病所带来的突变影响。整体而言，该数据集以全基因组测序为手段，将健康肝脏、肝硬化肝脏来源的干细胞克隆与肝癌活检组织并列，服务于肝脏肿瘤发生机制尤其是癌前病变突变效应研究。
【数据集背景】
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤 / 肝癌分类，主题标签为 Genomics。其研究背景聚焦于肝脏成体干细胞的克隆扩增现象，以及癌前肝病状态对基因组突变的影响。源站描述指出，研究涉及健康肝脏与肝硬化肝脏中克隆扩增的肝成体干细胞克隆，其中肝硬化肝脏的病因包括酒精滥用、NASH 和 PSC；同时还包括肝癌活检样本。通过全基因组测序，旨在确定癌前肝病所带来的突变影响。这一背景将肝脏慢性损伤、肝硬化、干细胞克隆扩增与肝癌发生联系起来，为理解肝癌前病变阶段的基因组改变提供了数据基础。
【数据内容】
数据内容涵盖三类样本来源：一是健康肝脏中克隆扩增的肝成体干细胞克隆；二是肝硬化肝脏中克隆扩增的肝成体干细胞克隆，其肝硬化病因包括酒精滥用、NASH 和 PSC；三是肝癌活检样本。上述样本均经过全基因组测序。数据集英文名称为 ena-DATASET-UMCU-02-05-2018-11:13:59:140-20 - samples。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序深度、覆盖度、变异类型、数据文件格式及具体临床注释等更细粒度的内容。
【采集与来源】
该数据集来源站为 omicsdi.org。源站描述表明，研究对象包括健康肝脏和肝硬化肝脏中克隆扩增的肝成体干细胞克隆，以及肝癌活检样本，并对其开展全基因组测序。肝硬化样本的病因涵盖酒精滥用、NASH 和 PSC。关于样本采集的具体机构、采集时间、伦理审批信息、患者数量及人口学特征等，源站未提供。
【适用场景】
基于其分类与主题标签，该数据集适用于肿瘤 / 肝癌方向的基因组学研究，尤其是围绕癌前肝病突变影响的分析。具体而言，可用于比较健康肝脏与肝硬化肝脏来源的肝成体干细胞克隆之间的基因组突变差异，也可用于探讨酒精滥用、NASH 和 PSC 相关肝硬化背景下的突变特征，并可与肝癌活检样本进行对照，以理解从癌前状态到肝癌的基因组变化。此外，该数据集也可服务于全基因组测序数据分析方法在肝脏疾病研究中的应用。除上述由分类、标签和源站描述直接支持的方向外，源站未提供其他具体适用场景。
【使用方法】
该数据集以全基因组测序样本形式提供，英文名称中包含“samples”字样。使用者可依据 omicsdi.org 来源站的相关入口获取数据。关于数据下载方式、文件组织格式、分析流程、参考基因组版本及配套工具等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集涉及健康肝脏、肝硬化肝脏来源的肝成体干细胞克隆以及肝癌活检样本，并经过全基因组测序，具备用于突变影响研究的潜力。但关于样本量、测序质量指标、覆盖深度、数据完整性、批次效应及潜在偏倚等信息，源站未提供。肝硬化病因涵盖酒精滥用、NASH 和 PSC，提示样本具有病因异质性，使用时应予以考虑。除上述内容外，源站未提供其他质量与限制说明。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款及数据共享政策等，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001004105
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对健康肝脏和肝硬化肝脏（由酒精滥用、NASH和PSC引起）中克隆扩增的肝成体干细胞克隆，以及肝癌活检样本进行了全基因组测序，以确定癌前肝病的突变影响。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
