马德卡酸在肝癌细胞中的生物信息学数据
该数据集包含针对肝癌细胞(HepG2)的蛋白质组学和RNA测序数据,通过实验方法研究马德卡酸及其修饰版本的抗肝癌分子机制,包括蛋白质相互作用鉴定和基因表达差异分析,主要用于药物靶标发现和基于结构的抗肝癌药物设计研究。
创建时间2025-10-30
更新时间2025-10-30
原始链接
https://figshare.com/articles/dataset/Bioinformatics_data_regarding_madecassic_acid_in_liver_cancer_cells/30477959
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资源简介
该数据集是针对马德卡酸(madecassic acid)在肝癌细胞中作用机制研究的生物信息学数据集。数据集包含蛋白质组学和RNA测序(RNAseq)数据。蛋白质组学数据通过将光亲和标签连接到马德卡酸,从HepG2肝癌细胞裂解液中富集与其相互作用的蛋白质,并使用质谱(MSMS)进行鉴定,包括空白对照、标记化合物以及不同浓度纯马德卡酸作为竞争剂的实验组。RNAseq数据则比较了使用马德卡酸及其修饰版本在1倍和3倍GI50浓度下,处理6小时和24小时后与未处理组之间的基因表达差异。数据来源为实验生成,主要应用于药物靶标发现、抗肝癌分子机制研究以及基于结构的药物修饰设计。
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