马德卡酸在肝癌细胞中的生物信息学数据
该数据集包含针对肝癌细胞（HepG2）的蛋白质组学和RNA测序数据，通过实验方法研究马德卡酸及其修饰版本的抗肝癌分子机制，包括蛋白质相互作用鉴定和基因表达差异分析，主要用于药物靶标发现和基于结构的抗肝癌药物设计研究。
基本信息
资源简介
马德卡酸在肝癌细胞中的生物信息学数据
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Bioinformatics data regarding madecassic acid in liver cancer cells》。配套论文《Identification of molecular pathways involved in the anti-liver cancer activity of madecassic acid》发表于 期刊（2025），DOI：10.1101/2025.08.17.670739。项目资助方：Homegrown solutions in Viet Nam: bringing C. asiatica compounds forward as candidates to treat liver cancer。源站首次发布：2025-10-30。
【数据内容】
源站原始描述：Madecassic acid has promising preliminary activity against liver cancer cells. Its activity is known to be improved through chemical modification. We have been seeking to understand the molecular mechanisms of madecassic acid''s activity so that it would be possible to design target-based modifications of the compound which would further improve activity. This dataset contains proteomics and RNAseq data. The proteomics was performed by attaching a photoaffinity tag to madecassic acid, and using t…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 19.00 GB。数据集 DOI：10.5522/04/30477959.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Pharmacology and pharmaceutical sciences not elsewhere classified。主题标签：Natural products、Madecassic acid、Liver cancer、Proteomics、RNAseq。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Pharmacology and pharmaceutical sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://rdr.ucl.ac.uk/articles/dataset/Bioinformatics_data_regarding_madecassic_acid_in_liver_cancer_cells/30477959
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Serpell, Chris (2025). Bioinformatics data regarding madecassic acid in liver cancer cells. University College London. Dataset
下载信息
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数据说明
该数据集是针对马德卡酸（madecassic acid）在肝癌细胞中作用机制研究的生物信息学数据集。数据集包含蛋白质组学和RNA测序（RNAseq）数据。蛋白质组学数据通过将光亲和标签连接到马德卡酸，从HepG2肝癌细胞裂解液中富集与其相互作用的蛋白质，并使用质谱（MSMS）进行鉴定，包括空白对照、标记化合物以及不同浓度纯马德卡酸作为竞争剂的实验组。RNAseq数据则比较了使用马德卡酸及其修饰版本在1倍和3倍GI50浓度下，处理6小时和24小时后与未处理组之间的基因表达差异。数据来源为实验生成，主要应用于药物靶标发现、抗肝癌分子机制研究以及基于结构的药物修饰设计。
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