肝细胞癌组织Affymetrix SNP芯片数据

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-29667

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

遗传变异在肿瘤发生和转移中起着重要作用。肝细胞癌（HCC）是癌症相关死亡的主要原因之一。尽管监测和临床治疗策略有所改善，HCC的预后仍然不佳。采用Affymetrix SNP 6.0芯片评估了30例接受肝移植的HBV相关HCC患者肿瘤DNA的遗传特征。筛选并验证了与复发相关的SNP。按照制造商说明，对从福尔马林固定石蜡包埋的HCC组织中提取的DNA进行了Affymetrix SNP 6.0芯片检测。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。