TCGA头颈鳞癌影像数据集

TCIA收录的TCGA头颈鳞癌医学影像数据,可结合TCGA临床和组学信息使用。由The Cancer Imaging Archive提供,来自The Cancer Imaging Archive,包含医学影像数据,适用于分类任务,许可证为CC BY 4.0,专注于肿瘤领域的唇癌研究。

The Cancer Imaging ArchiveThe Cancer Imaging Archive
The Cancer Imaging Archive
浏览 14
图像分类Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
TCGA-HNSC

基本信息

模态
图像
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2026-10-01
版本
Complete

资源简介

TCGA头颈鳞癌影像数据集

【一句话概览】

本数据集是 TCIA 公开的影像数据集,收录 合计 129.63 GB、227 例受试者,主题涵盖 Head and Neck Squamous Cell Carcinoma,可用于医学图像分割、检测与分类模型的训练与评测,TCIA Site License 许可开放获取。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《The Cancer Genome Atlas Head-Neck Squamous Cell Carcinoma Collection》。源站首次发布:2023/05/24。

【数据内容】

源站原始描述:Total Cases by Site Site Patients MDA (TSS code “-CV-“) 78 UNC (TSS code “-BA-“) 22 UPMC (TSS code “-CN-“) 5 Vanderbilt (TSS code “-CR-“) 51 JHU (TSS code “-BB-“) 15 Miami (TSS code “-IQ-“) 5 Barretos (TSS code “-UF-“) 16 UHN (TSS code “-CQ-“) 35 Total 227 Total Cases by Modality and Site Site CT MR PT Grand Total JHU 14 3 5 22 MDA 78 6 6 90 UNC 20 2 2 24 UPMC 5 5 10 Vanderbilt 50 5 15 70 Miami 5 5 Barretos 16 16 UHN 23 12 35 Grand Total 211 28 33 272 GDC Data Portal – Clinical and Genomic Data…

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.7937/K9/TCIA.2016.LXKQ47MS。

【主题与分类】

源站学科分类:CT、PT、MR、RTDOSE、RTSTRUCT、RTPLAN。主题标签:Head and Neck Squamous Cell Carcinoma。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.cancerimagingarchive.net/collection/tcga-hnsc/

使用许可:TCIA Site License(https://creativecommons.org/licenses/by/3.0/)。

规范引用:Zuley, M. L., Jarosz, R., Kirk, S., Lee, Y., Colen, R., Garcia, K., Delbeke, D., Pham, M., Nagy, P., Sevinc, G., Goldsmith, M., Khan, S., Net, J. M., Lucchesi, F. R., & Aredes, N. D. (2016). The Cancer Genome Atlas Head-Neck Squamous Cell Carcinoma Collection (TCGA-HNSC) (Version 6) [Data set] . The…

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(TCIA 标准方式)

方式一:NBIA 搜索

  1. 打开 NBIA 搜索页(免费注册 TCIA 账号);
  2. 按本数据集 Collection 名称筛选(见源站页面),加入 Download Basket;
  3. 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。

方式二:NBIA API(程序化)

curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json

方式三:TCIA Manifest + dicomsort

在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。

数据说明

TCIA收录的TCGA头颈鳞癌医学影像数据,可结合TCGA临床和组学信息使用。

数据加载示例(DICOM 影像)

import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array

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