TCGA头颈鳞癌影像数据集
TCIA收录的TCGA头颈鳞癌医学影像数据,可结合TCGA临床和组学信息使用。由The Cancer Imaging Archive提供,来自The Cancer Imaging Archive,包含医学影像数据,适用于分类任务,许可证为CC BY 4.0,专注于肿瘤领域的唇癌研究。

基本信息
资源简介
TCGA头颈鳞癌影像数据集
【一句话概览】
本数据集是 TCIA 公开的影像数据集,收录 合计 129.63 GB、227 例受试者,主题涵盖 Head and Neck Squamous Cell Carcinoma,可用于医学图像分割、检测与分类模型的训练与评测,TCIA Site License 许可开放获取。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《The Cancer Genome Atlas Head-Neck Squamous Cell Carcinoma Collection》。源站首次发布:2023/05/24。
【数据内容】
源站原始描述:Total Cases by Site Site Patients MDA (TSS code “-CV-“) 78 UNC (TSS code “-BA-“) 22 UPMC (TSS code “-CN-“) 5 Vanderbilt (TSS code “-CR-“) 51 JHU (TSS code “-BB-“) 15 Miami (TSS code “-IQ-“) 5 Barretos (TSS code “-UF-“) 16 UHN (TSS code “-CQ-“) 35 Total 227 Total Cases by Modality and Site Site CT MR PT Grand Total JHU 14 3 5 22 MDA 78 6 6 90 UNC 20 2 2 24 UPMC 5 5 10 Vanderbilt 50 5 15 70 Miami 5 5 Barretos 16 16 UHN 23 12 35 Grand Total 211 28 33 272 GDC Data Portal – Clinical and Genomic Data…
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:10.7937/K9/TCIA.2016.LXKQ47MS。
【主题与分类】
源站学科分类:CT、PT、MR、RTDOSE、RTSTRUCT、RTPLAN。主题标签:Head and Neck Squamous Cell Carcinoma。
【适用方向】
影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。
【获取与许可】
源站页面:https://www.cancerimagingarchive.net/collection/tcga-hnsc/
使用许可:TCIA Site License(https://creativecommons.org/licenses/by/3.0/)。
规范引用:Zuley, M. L., Jarosz, R., Kirk, S., Lee, Y., Colen, R., Garcia, K., Delbeke, D., Pham, M., Nagy, P., Sevinc, G., Goldsmith, M., Khan, S., Net, J. M., Lucchesi, F. R., & Aredes, N. D. (2016). The Cancer Genome Atlas Head-Neck Squamous Cell Carcinoma Collection (TCGA-HNSC) (Version 6) [Data set] . The…
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取(TCIA 标准方式)
方式一:NBIA 搜索
- 打开 NBIA 搜索页(免费注册 TCIA 账号);
- 按本数据集 Collection 名称筛选(见源站页面),加入 Download Basket;
- 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。
方式二:NBIA API(程序化)
curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json
方式三:TCIA Manifest + dicomsort
在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。
数据说明
TCIA收录的TCGA头颈鳞癌医学影像数据,可结合TCGA临床和组学信息使用。
数据加载示例(DICOM 影像)
import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array
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