全基因组测序(ChromoSeq)作为AML和MDS常规基因组分析的辅助手段

该数据集来自clinicaltrials.gov,为单中心前瞻性研究,评估全基因组测序检测ChromoSeq在急性髓系白血病(AML)和骨髓增生异常综合征(MDS)患者中作为常规基因组检测辅助手段的可行性

Washington University School of MedicineWashington University School of Medicine
clinicaltrials
浏览 9
基因组Whole Genome SequencingAcute Myeloid LeukemiaMyelodysplastic Syndromes
Whole Genome Sequencing (ChromoSeq) as an Adjunct to Conventional Genomic Profiling in AML and MDS

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

全基因组测序(ChromoSeq)作为AML和MDS常规基因组分析的辅助手段

该数据集英文名为 Whole Genome Sequencing (ChromoSeq) as an Adjunct to Conventional Genomic Profiling in AML and MDS,来源于 clinicaltrials.gov,本站归类为肿瘤 / 白血病方向。其核心是一项单中心、前瞻性研究,评估全基因组测序检测 ChromoSeq 在急性髓系白血病(AML)和骨髓增生异常综合征(MDS)患者中作为常规基因组检测辅助手段的可行性。研究利用前瞻性收集的患者数据,并结合医师调查,考察在标准基因组检测之外增加 ChromoSeq 的实际实施可行性。数据集围绕全基因组测序、急性髓系白血病、骨髓增生异常综合征等主题组织,面向血液肿瘤领域的基因组研究与临床转化应用。

【数据集背景】

急性髓系白血病(AML)和骨髓增生异常综合征(MDS)是血液系统恶性肿瘤的重要类型,其临床诊疗高度依赖基因组层面的分型与风险评估。常规基因组检测在实践中已广泛使用,而全基因组测序能否作为其补充手段进入实际工作流程,需要从可行性角度加以验证。该数据集所依托的研究正是针对这一问题设计:以单中心、前瞻性方式,评估全基因组测序检测 ChromoSeq 作为常规基因组检测辅助手段,在 AML 和 MDS 患者中的实施可行性。研究同时关注医师层面的反馈,通过医师调查了解在真实临床环境中引入该检测的可行性与接受程度。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括 Whole Genome Sequencing、Acute Myeloid Leukemia、Myelodysplastic Syndromes,内容围绕全基因组测序检测 ChromoSeq 在 AML 与 MDS 患者中的应用展开。研究所涉及的条件包括全基因组测序、急性髓系白血病和骨髓增生异常综合征。数据来源于前瞻性收集的患者数据,并配合医师调查结果,用于判断将 ChromoSeq 附加于标准基因组检测之上的可行性。关于具体的样本量、测序覆盖深度、变异检出指标、医师调查问卷条目及统计分析方法等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 clinicaltrials.gov,对应一项单中心、前瞻性研究。研究采用前瞻性方式收集患者数据,并同步开展医师调查,以获取临床实施层面的信息。研究聚焦于被诊断为急性髓系白血病或骨髓增生异常综合征的患者人群。关于招募时间窗、入排标准的具体条款、参与中心数量之外的机构信息、数据采集时间点与随访安排等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于血液肿瘤特别是 AML 与 MDS 领域的基因组检测研究与临床转化评估场景,可用于探讨全基因组测序作为常规基因组检测辅助手段的可行性,也可用于了解临床医师对该类检测引入实际诊疗流程的态度与反馈。其单中心前瞻性设计特点,使其适合作为相关检测实施路径的探索性参考。关于该数据集在其他具体研究场景中的验证性用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集依托前瞻性收集的患者数据与医师调查结果,围绕 ChromoSeq 附加于标准基因组检测的可行性这一目标组织使用。使用时应结合研究设定的单中心前瞻性框架理解其数据含义。关于数据访问方式、下载渠道、文件格式、字段说明及配套分析工具等,源站未提供。

【质量与限制】

该研究为单中心、前瞻性设计,其结论与数据的外推范围受此设计特征约束;研究目标为可行性评估,而非以疗效或诊断准确性为主要终点。关于样本规模、缺失数据情况、偏倚控制措施及统计效能等具体质量指标,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 clinicaltrials.gov,引用时应标注其英文名称 Whole Genome Sequencing (ChromoSeq) as an Adjunct to Conventional Genomic Profiling in AML and MDS 及来源站信息。关于具体的许可条款、使用协议与引用格式要求,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT04986657

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:全基因组测序、急性髓系白血病、骨髓增生异常综合征。这是一项单中心、前瞻性研究,研究对象为全基因组测序检测方法ChromoSeq。利用前瞻性收集的患者数据,结合医生调查,研究者旨在确定在急性髓系白血病(AML)或骨髓增生异常综合征(MDS)患者中,除标准基因组检测外实施ChromoSeq的可行性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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