人类T细胞急性淋巴细胞白血病全基因组表达芯片数据集

资源简介

人类T细胞急性淋巴细胞白血病全基因组表达芯片数据集

该数据集英文名为 Whole Genome Expression Array in Human T-cell Acute Lymphoblastic Leukemia，收录于 ebi.ac.uk，本站归类为肿瘤 / 白血病。数据集以转录组芯片（transcription profiling by array）为主题标签，物种为 Homo sapiens，核心内容是儿童 T 细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）患者诊断时骨髓样本与胸腺细胞亚群的全基因组表达谱比较。源站描述显示，研究将儿童 T-ALL 样本与经 FACS 分选的多个胸腺细胞亚群进行对照，并在该队列中比较 Wnt 信号通路关键分子的表达情况。数据可用于比较 T-ALL 与正常胸腺细胞亚群的转录谱差异，分析 Wnt 信号通路关键分子的表达特征，服务于白血病分类与机制研究。

【数据集背景】

T 细胞急性淋巴细胞白血病是儿童中重要的血液系统恶性肿瘤，其发生发展与正常 T 细胞在胸腺内的分化过程密切相关。为理解白血病细胞的转录特征及其与正常胸腺细胞发育阶段的对应关系，需要在全基因组水平上比较患者样本与不同分化阶段的胸腺细胞亚群。该数据集正是围绕儿童 T-ALL 诊断时样本与胸腺细胞亚群的表达谱对照而建立，并在同一队列中考察 Wnt 信号通路关键分子的表达，为白血病分类与机制研究提供转录组层面的数据基础。

【数据内容】

数据集包含儿童 T-ALL 患者诊断时骨髓样本的全基因组表达芯片数据，以及作为对照的胸腺细胞亚群表达数据。源站描述指出，患者骨髓样本在诊断时采集，原始细胞计数超过 90%，RNA 经分离后杂交至 Affymetrix GeneChip HU-133 Plus.2 芯片。胸腺细胞亚群经 FACS 分选，标注为 DN（CD3、CD4、CD8 阴性）、DP3poz tot（CD3、CD4、CD8 阳性）、DP3neg（CD3 阴性，CD4、CD8 阳性）、ISP（未成熟单阳性）、SP4（CD4 单阳性）和 SP8（CD8 单阳性）。数据主题为转录组芯片表达谱，物种为人。

【采集与来源】

数据来源站为 ebi.ac.uk，源站描述提供了样本采集与处理的关键信息：儿童 T-ALL 患者骨髓样本于诊断时获取，要求原始细胞计数超过 90%；RNA 从骨髓样本中分离并杂交至 Affymetrix GeneChip HU-133 Plus.2。胸腺细胞亚群通过 FACS 分选获得，并按 CD3、CD4、CD8 表达状态划分为上述六个亚群。数据以转录组芯片表达谱的形式组织，供比较 T-ALL 与胸腺细胞亚群之间的转录差异。

【适用场景】

该数据集适用于儿童 T-ALL 与正常胸腺细胞亚群之间全基因组转录谱差异的比较研究；可用于分析 Wnt 信号通路关键分子在该队列中的表达特征；可支持白血病分类相关研究，以及 T-ALL 细胞与不同胸腺细胞分化阶段对应关系的机制探索。主题标签表明其属于转录组芯片表达谱数据，物种为人，适合人类白血病与胸腺细胞发育相关的转录组分析场景。

【使用方法】

使用时可将儿童 T-ALL 诊断时骨髓样本的表达谱与经 FACS 分选的胸腺细胞亚群（DN、DP3poz tot、DP3neg、ISP、SP4、SP8）表达谱进行对照比较，识别差异表达基因与转录谱特征；围绕 Wnt 信号通路关键分子开展表达特征分析；结合样本的亚群标注与疾病状态进行分组比较。具体数据处理流程、归一化方法与分析参数源站未提供。

【质量与限制】

源站描述明确了患者样本的诊断时点与原始细胞计数超过 90% 的纳入条件，以及胸腺细胞亚群的分选标注方式，但未提供样本量、测序或芯片杂交的技术重复、数据质控指标等信息，源站未提供。数据仅覆盖儿童 T-ALL 诊断时骨髓样本与胸腺细胞亚群，其他疾病阶段、其他样本类型或成人患者情况源站未提供。使用时应结合源站原始记录核实样本与分组信息。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可条款信息。