呼吸样本中挥发性有机化合物用于IPA诊断

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05982912

标准获取流程：

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：侵袭性肺曲霉病、呼气样本、挥发性有机化合物。背景 侵袭性肺曲霉病（IPA）的诊断对免疫抑制患者的预后和治疗方案具有严重影响。曲霉属在环境中无处不在，进而导致此类菌株在健康人呼吸系统中普遍存在，这给诊断带来了巨大挑战。也就是说，将IPA与呼吸道非侵袭性定植区分开来可能颇具挑战性。

免疫功能低下患者的患病率大幅上升，包括恶性肿瘤及肿瘤治疗、造血干细胞和实体器官移植以及免疫调节药物，这加剧了上述困境。(1) 特别是，急性髓系白血病（AML）患者发生IPA的风险很高，其中5-15%的患者在AML诊断后的前3个月内发生IPA。(1-3) 由于高达5%的AML患者在就诊时可能已存在IPA，因此在Rambam医学中心（RMC）新诊断的AML患者入院时常规接受胸部计算机断层扫描（CT），作为诊断时IPA存在的筛查以及日后怀疑IPA时的基线参考。(3) 在AML患者中诊断可能或确诊的IPA需要提示性影像学表现以及微生物学证据。虽然在某些情况下可使用外周血中的生物标志物（主要是d-半乳甘露聚糖抗原和/或曲霉属聚合酶链反应）进行诊断，但这些检测的敏感性较低，且这种微创方法往往无法提供足够的诊断确定性。

在这种情况下，通常会进行支气管镜检查并伴随支气管肺泡灌洗。对于疑似IPA的患者而言，这种侵入性操作尤为危险，因为绝大多数患者因基础疾病而极为虚弱。（4）这些考量促使人们探索诊断IPA的其他非侵入性方法。（5）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。