鲸类同源群与层级同源群肿瘤抑制基因fasta文件

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A74ddf5fb83d9d42fdf1c2a4cb3dfb61d625c1c51bdcb9a7b56f93cec6268841b

标准获取流程：

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数据说明

鲸类是最长寿的哺乳动物物种，也是地球历史上体型最大的哺乳动物。它们已演化出抵御癌症等疾病的机制，尽管这些机制的潜在分子基础仍不清楚。本研究旨在探究自然选择在鲸类1077个抑癌基因（TSGs）演化中的作用。我们采用比较基因组学方法，分析了分子变异的两个来源，即dN/dS比值和基因拷贝数变异。我们在鲸类祖先的CXCR2基因中发现了正选择信号，该基因是DNA损伤、肿瘤播散和免疫系统的重要调控因子。此外，在须鲸祖先中，我们发现六个基因表现出正选择，与乳腺癌、肺肿瘤（ADAMTS8）和白血病（ANXA1）等疾病相关。与其他哺乳动物相比，鲸类抑癌基因的周转率（基因获得与丢失）几乎高出2.4倍，而在须鲸中明显更快。

在须鲸中发现的TSGs分子变异，加之更快的基因周转率，可能促进了其抗癌抗性、巨大体型和长寿等特定特征的演化。此外，我们报告了71个存在重复的基因，其中11个与长寿相关（例如NOTCH3和SIK1），并且是衰老、细胞增殖和代谢的重要调节因子。总体而言，这些结果为肿瘤抑制基因中的自然选择可能作用于体型庞大且寿命延长的物种提供了演化证据，为疾病抗性的遗传基础提供了新的见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。