慢性淋巴细胞白血病转录组分析揭示与SF3B1突变相关的异构体调控

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-2025

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

几项针对慢性淋巴细胞白血病（CLL）的DNA测序研究显示，剪接因子SF3B1在大约10%的患者中积累了体细胞点突变。在大多数情况下，这些突变位于编码C端HEAT重复结构域的基因组区域，并且许多情况下，突变导致了特定的氨基酸替换。在此，我们旨在探究CLL肿瘤细胞中与SF3B1 K700E突变相关的 Sicher 外显子使用差异。我们生成了来自两名SF3B1突变患者、两名SF3B1未突变患者以及健康供体的RNA-Seq转录组数据。我们报告了这些基因中替代外显子使用的有趣实例及其可能后果。本数据集仅包含处理RNA测序原始数据后生成的文件，此举避免了潜在的患者身份识别问题，同时确保了出版物中所述结果的完全可重复性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。